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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000556`

染色体: Chr05 坐标: 4187028-4191045 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000556`
名称	SmilChr05G000556
描述	SH3 domain-containing protein 3
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	4187028 - 4191045 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985295`
GeneID	`130985295`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985295`
原始查询	`SmilChr05G000556`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	SH3 domain-containing protein 3
产物	SH3 domain-containing protein 3
Arabidopsis	`AT4G18060` (AT4G18060) SH3 domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827531] identity=71.8; qcov=0.852; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0508300` (OJ1163_G04.105) - identity=62.6; qcov=0.83; evalue=4e-154; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00018 (SH3_1); PF07653 (SH3_2); PF14604 (SH3_9)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985295

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057764182.1`
2	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	1.00000	`XP_057764182.1`
3	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057764182.1`
4	Vesicle	囊泡	0.80000	`XP_057764182.1`
5	Endocytic vesicle	Endocytic vesicle	0.60000	`XP_057764182.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:4187077`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	62	A10,A15,A20,A22,A24,A6,A7,B10,B104,B105,B108,B110,B122,B126,B131,B134,B136,B14,B15,B16,B25,B3,B4,B43,B44,B5,B52,B57,B58,B59,B62,B66,B73,B74,B76,B82,B84,B89,B94,B95,C15,C18,C24,C3,C30,C32,C42,C44,C52,C61,C64,C66,C68,C7,C75,C79,C82,C86,C87,D3,D7,D8
`Chr5:4187102`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	18	A10,A16,A18,A4,A6,B125,B132,B46,B67,B81,B93,C1,C15,C16,C30,C31,C33,C76
`Chr5:4187114`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B14,B80,C58
`Chr5:4187203`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B52,B94,C7
`Chr5:4187203`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B52,B94,C7
`Chr5:4187210`	`ACT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	9	A19,A2,A5,A9,B72,B83,C10,C20,C75
`Chr5:4187541`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr5:4188486`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,D7,D8
`Chr5:4189714`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,C14
`Chr5:4190031`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20
`Chr5:4190207`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A8,B135,B30,C23,C76
`Chr5:4190528`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764182.1

412 aa

206

412

SH3_1

SH3_9

SH3_2

PF00018 SH3_1 349-393 aa PF14604 SH3_9 349-397 aa PF07653 SH3_2 354-398 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764182.1`	Pfam	`PF00018`	SH3_1	Domain	349	393	1.1e-09	38.4	SH3 domain
`XP_057764182.1`	Pfam	`PF14604`	SH3_9	Domain	349	397	1.9e-10	41.1	Variant SH3 domain
`XP_057764182.1`	Pfam	`PF07653`	SH3_2	Domain	354	398	2.5e-08	34.2	Variant SH3 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908199.1
AATGTAAAAACAAGATCGTAACATTTCACCGACGTGGATGCTCTACCTCCTTAATTGTAACATTTCGTTGATTTTGATTATCTCAAGGCTACGAGTATACAGCTGCAATCAAAGAGAAGATCTGAATACTGACGAGCGCCTGAGTTCGGAGCGCCGTTGTTTTGTCCGAACTATTCAAAATCACTGTGCATTGGGGCTCCAGGAGATTCACAGTGGGGAAGCGGCGGCAATGGATGCTTTCAGGAAACAAGCCAGTAAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985295
ATGCTCTACCTCCTTAATTGTAACATTTCGTTGATTTTGATTATCTCAAGGCTACGAGTATACAGCTGCAATCAAAGAGAAGATCTGAATACTGACGAGCGCCTGAGTTCGGAGCGCCGTTGTTTTGTCCGAACTATTCAAAATCACTGTGCATTGGGGCTCCAGGAGATTCACAGTGGGGAAGCGGCGGCAATGGATGCTTTCAGGAAACAAGCCAGTAAACTCAGAGAGCAAGTCGCCAAGCAGCAGCAGGCTGTGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764182.1
MLYLLNCNISLILIISRLRVYSCNQREDLNTDERLSSERRCFVRTIQNHCALGLQEIHSGEAAAMDAFRKQASKLREQVAKQQQAVIKQFGGSGYESSEVMVIDEVELQMHHQLEKLYRSTRSGREFQKEVVKAAEAFTAVGYKHIEAGTKLSEDCSRYGAENAYDEALAKATSVYGEARKHVEREQDDFNRLLFTQVLEPLRAMINGTPLEDARHLAQRYSKMRQEAEAQAAEVFRRQARVRESPIPDNVAKLHAAETR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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