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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000564`

染色体: Chr05 坐标: 4242065-4248077 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000564`
名称	SmilChr05G000564
描述	ABC transporter B family member 9-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	4242065 - 4248077 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985228`
GeneID	`130985228`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985228`
原始查询	`SmilChr05G000564`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ABC transporter B family member 9-like
产物	ABC transporter B family member 9-like
Arabidopsis	`AT4G18050` (ABCB9) P-glycoprotein 9 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827530] identity=66.7; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0695700` (OsABCB4) - identity=56; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0016020 (membrane); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity); GO:0055085 (transmembrane transport); GO:0140359 (ABC-type transporter activity)
KEGG	smil02010 (ABC transporters - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00005 (ABC_tran); PF00664 (ABC_membrane)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985228

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057764050.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764050.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764050.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764050.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057764050.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:4242334`	`ATC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	13	A20,B100,B118,B139,B26,B45,B6,B77,B86,C10,C40,C51,C63
`Chr5:4242738`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8
`Chr5:4243756`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr5:4243793`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B139
`Chr5:4243808`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,B68,C12,C5,C63
`Chr5:4243810`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C19
`Chr5:4243900`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A10
`Chr5:4244035`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B52
`Chr5:4244123`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,B34
`Chr5:4244199`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,B114,B52,B66,C47
`Chr5:4244461`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A15
`Chr5:4244561`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764050.1

1232 aa

616

1232

ABC_membrane

ABC_tran

ABC_membrane

ABC_tran

PF00664 ABC_membrane 36-305 aa PF00005 ABC_tran 375-522 aa PF00664 ABC_membrane 688-958 aa PF00005 ABC_tran 1028-1157 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764050.1`	Pfam	`PF00664`	ABC_membrane	Family	36	305	2e-112	376.1	ABC transporter transmembrane region
`XP_057764050.1`	Pfam	`PF00005`	ABC_tran	Domain	375	522	1.5e-54	185.0	ABC transporter
`XP_057764050.1`	Pfam	`PF00664`	ABC_membrane	Family	688	958	2e-112	376.1	ABC transporter transmembrane region
`XP_057764050.1`	Pfam	`PF00005`	ABC_tran	Domain	1028	1157	1.5e-54	185.0	ABC transporter

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908067.1
AGTTTATGAGATCACAATTCGATAATTGTTTCTCGCTTCGAAATTTTCTGAATCGCAGAATAGATGGCCGATCCGGCGGCGACGACGCTATCTGAGAAGAAGGAGGAGGAGAAAGTGCCGTATTATAAACTGTTTTCTTTTGCAGACAAGCTTGATGTACTTCTAATGGTGGTCGGGGCAATCGCAGCCATCGGGAATGGGGTGTCGCAGCCGCTCATGACGCTTATTTTCGGCGAGTTGGTGGATTCCTTCGGCGGAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985228
ATGGCCGATCCGGCGGCGACGACGCTATCTGAGAAGAAGGAGGAGGAGAAAGTGCCGTATTATAAACTGTTTTCTTTTGCAGACAAGCTTGATGTACTTCTAATGGTGGTCGGGGCAATCGCAGCCATCGGGAATGGGGTGTCGCAGCCGCTCATGACGCTTATTTTCGGCGAGTTGGTGGATTCCTTCGGCGGAGGTGATAAATCATCAATTGTGCATGCAGTTTCGAAGGTAGCGTTGAAATTGGTATACTTGGGCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764050.1
MADPAATTLSEKKEEEKVPYYKLFSFADKLDVLLMVVGAIAAIGNGVSQPLMTLIFGELVDSFGGGDKSSIVHAVSKVALKLVYLGIGAGVASLLQMMCWMVTGERQAARIRGLYLKTILRQDIEFFDTQTSTGEIIGRMSGDTILIQDAMGEKVGNFIQFASTFLGGFLIAFCRGWLLAIVLCTCIPALGIAGAFSAVLVGKMATLGQAAYAEAGNVVEQTVGSIRTVQSFTGEKQAVDKYDSKLQIAYKAAAKQGLAS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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