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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000565`

染色体: Chr05 坐标: 4250011-4251895 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000565`
名称	SmilChr05G000565
描述	oxoglutarate-dependent flavonoid 7-O-demethylase 1-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	4250011 - 4251895 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985292`
GeneID	`130985292`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985292`
原始查询	`SmilChr05G000565`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	oxoglutarate-dependent flavonoid 7-O-demethylase 1-like
产物	oxoglutarate-dependent flavonoid 7-O-demethylase 1-like
Arabidopsis	`AT1G17020` (SRG1) senescence-related 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838272] identity=53.4; qcov=1.01; evalue=2.89e-143; confidence=high
Rice	`Os10g0559500` (FLS) - identity=40.1; qcov=0.989; evalue=1.1e-98; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03171 (2OG-FeII_Oxy); PF14226 (DIOX_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985292

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057764179.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057764179.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057764179.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764179.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764179.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:4250128`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	A7,B13,B62,D5
`Chr5:4250128`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	CDS_variant	4	A7,B13,B62,D5
`Chr5:4250133`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr5:4250184`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr5:4250220`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,B114,C47
`Chr5:4250253`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr5:4250342`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B66,C14,C54
`Chr5:4250348`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,C12,C48,C54
`Chr5:4250758`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr5:4250809`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,B112,B73,B75
`Chr5:4250922`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	10	B129,B21,B35,B55,C2,C22,C54,C56,C7,C8
`Chr5:4250949`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	165	A10,A11,A13,A14,A15,A16,A18,A2,A20,A21,A23,A3,A4,A5,A6,A7,A8,A9,B1,B10,B100,B102,B103,B104,B106,B11,B110,B111,B112,B113,B117,B118,B120,B121,B122,B123,B125,B126,B127,B129,B13,B132,B133,B134,B135,B139,B14,B15,B16,B17,B2,B21,B22,B24,B26,B28,B29,B3,B30,B33,B34,B35,B36,B37,B38,B39,B45,B46,B47,B48,B49,B52,B53,B54,B55,B58,B59,B6,B60,B61,B62,B63,B64,B65,B66,B67,B68,B7,B73,B74,B77,B78,B8,B80,B81,B85,B86,B87,B88,B90,B91,B92,B93,B97,B98,C1,C10,C13,C16,C19,C2,C20,C21,C22,C23,C24,C26,C30,C31,C33,C36,C37,C38,C39,C4,C40,C41,C43,C46,C47,C48,C49,C50,C53,C54,C55,C56,C57,C58,C59,C6,C60,C62,C63,C65,C67,C7,C73,C76,C77,C78,C79,C8,C81,C83,C84,C9,D1,D10,D11,D2,D4,D5,D6,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764179.1

356 aa

178

356

DIOX_N

2OG-FeII_Oxy

PF14226 DIOX_N 51-157 aa PF03171 2OG-FeII_Oxy 206-304 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764179.1`	Pfam	`PF14226`	DIOX_N	Family	51	157	1.7e-28	100.3	non-haem dioxygenase in morphine synthesis N-terminal
`XP_057764179.1`	Pfam	`PF03171`	2OG-FeII_Oxy	Domain	206	304	3.5e-36	124.3	2OG-Fe(II) oxygenase superfamily

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908196.1
ATGCGATTAATAAACCAGTTAATAAGATATCAATATATTGAACTATACTAAAATAAATAAAATCTTTAAAAGTTTGAAACAAGATATATGAAAGTGAAACATAAAAATAAAATAGATGATCACAATGCACCTACTTGCAAATTATCATAATATAATATGGAAATTGAAGTTGACACAAATGCATAAAAACTAGAGAGAGAGAGAGACATATTAGGCCGGTCACTGAAGGTAGAACTTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985292
ATGGAATCAAAGGCGCAGATATTAGGCAGATCACTGAAGGTGCCAATTGTGCAAGAACTTGCAAAGGAGAAACTGAGCAGTGTGCCGTCGAGATACATCCGACCCGATCACCAACATCTCACCGCCGCCGATGTTTCCTCCCTACCTCAAATCCCCGTCATCGATATGCAGAAGCTGCTCCTCTCAGATTCCATGGATTCCGAGCTTCACAGGCTGCACGAAGCTTGCCTAGATTGGGGTTTCTTCCAGTTGATCAACCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764179.1
MESKAQILGRSLKVPIVQELAKEKLSSVPSRYIRPDHQHLTAADVSSLPQIPVIDMQKLLLSDSMDSELHRLHEACLDWGFFQLINHGVEAAPIAKMRSEMTAFFNLPPEEKDVFRQKEDDVEGYGQAFVTSQEQKLDWADLFFVLTSPPYLRKPHLIPKLPASFRDAIDEYGADLRNLAMKILGYMAKALGMKGEEMRSAFDEGTQAMRMNYYPPCPQPELVTGLCPHSDAVALTILLQVNDMSGLQVSKDGKWIPVSP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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