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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000569`

染色体: Chr05 坐标: 4276554-4277564 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000569`
名称	SmilChr05G000569
描述	somatic embryogenesis receptor kinase 2-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	4276554 - 4277564 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024801`
GeneID	`131024801`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024801`
原始查询	`SmilChr05G000569`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	somatic embryogenesis receptor kinase 2-like
产物	somatic embryogenesis receptor kinase 2-like
Arabidopsis	`AT1G34210` (SERK2) somatic embryosis receptor-like kinase 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840320] identity=95.7; qcov=0.716; evalue=1.01e-106; confidence=high
Rice	`Os04g0457800` (OsSERK2) - identity=93.2; qcov=0.716; evalue=3.28e-107; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024801

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057810320.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057810320.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057810320.1`
4	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057810320.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810320.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:4276568`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B10,B105,B32,B75,C35
`Chr5:4276579`	`AAC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B100
`Chr5:4276579`	`AAC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B100
`Chr5:4276904`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B20,B65,C31
`Chr5:4276904`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B20,B65,C31
`Chr5:4276908`	`G`	`GGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	63	A18,A3,A4,A8,A9,B10,B101,B104,B11,B112,B117,B120,B124,B129,B134,B135,B14,B23,B3,B33,B42,B43,B48,B49,B5,B50,B52,B55,B59,B6,B63,B64,B78,B80,B89,B90,B92,B94,B98,B99,C1,C19,C20,C22,C24,C26,C31,C33,C36,C43,C44,C49,C53,C55,C57,C62,C67,C7,C73,C82,C87,D1,D6
`Chr5:4276916`	`A`	`AGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	8	B10,B117,B5,B98,C44,C53,C57,C67
`Chr5:4276918`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B135,C2,C62
`Chr5:4276918`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B135,C2,C62
`Chr5:4276919`	`GA`	`*`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B135,C2,C62
`Chr5:4276921`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B99,C87
`Chr5:4276921`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B99,C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810320.1

225 aa

112

225

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 37-198 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 38-198 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810320.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	37	198	1.3e-22	81.1	Protein kinase domain
`XP_057810320.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	38	198	1.9e-20	74.0	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954337.1
ATGATCTCCAAAATCGCATCATCAAAACCAGTAAATGCATATAAAAAGAAGCGCATGCAAACTAATGAACATAGATTTTTCTTAATTGCGGGGGAGAGAGAGAGAGAGAGATTATCTTATCTGCACGATCACTGTGACCCGAAGATCATTCACCGTGATGTGAAAGCCGCAAATATACTATTGGACGAAGAGTTTGAGGCGGTCGTTGGAGATTTTGATTTGGCGAAGCTCATGGATTACAAGGATACACACGTGACCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024801
ATGATCTCCAAAATCGCATCATCAAAACCAGTAAATGCATATAAAAAGAAGCGCATGCAAACTAATGAACATAGATTTTTCTTAATTGCGGGGGAGAGAGAGAGAGAGAGATTATCTTATCTGCACGATCACTGTGACCCGAAGATCATTCACCGTGATGTGAAAGCCGCAAATATACTATTGGACGAAGAGTTTGAGGCGGTCGTTGGAGATTTTGATTTGGCGAAGCTCATGGATTACAAGGATACACACGTGACCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810320.1
MISKIASSKPVNAYKKKRMQTNEHRFFLIAGERERERLSYLHDHCDPKIIHRDVKAANILLDEEFEAVVGDFDLAKLMDYKDTHVTTAVRGTIGHIAPEYLSTGKSSEKTDVFGYAIMLLELITGQRAFDLARLANDDDVMLLDWVKGLLKEKKVEMLVDPDLQKNYVEAEVEQLIQVVLLCTQSSPMERPKMSEVVRKNTCSQHIHTQPNRGHRRGRCRRWKRE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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