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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000573`

染色体: Chr05 坐标: 4310740-4314637 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000573`
名称	SmilChr05G000573
描述	subtilisin-like protease SBT5.6
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	4310740 - 4314637 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985237`
GeneID	`130985237`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985237`
原始查询	`SmilChr05G000573`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	subtilisin-like protease SBT5.6
产物	subtilisin-like protease SBT5.6
Arabidopsis	`AT5G45650` (AT5G45650) subtilase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834605] identity=52.1; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0198700` (OsSub12) - identity=41.8; qcov=1.01; evalue=0; confidence=medium
GO	GO:0004252 (serine-type endopeptidase activity); GO:0006508 (proteolysis)
KEGG	-
Pfam	PF00082 (Peptidase_S8); PF05922 (Inhibitor_I9); PF17766 (fn3_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985237

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057764064.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.40000	`XP_057764064.1`
3	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057764064.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764064.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764064.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:4310889`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	25	A11,A22,B119,B124,B130,B135,B137,B139,B28,B48,B54,B85,C13,C20,C21,C29,C41,C46,C50,C56,C6,C60,C73,C78,C85
`Chr5:4311146`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr5:4311183`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr5:4311227`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,B127,B50,C28,C4
`Chr5:4311269`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B7,B79,C14,C27
`Chr5:4311931`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B62,C62
`Chr5:4311944`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	A9,C1
`Chr5:4311944`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,C1
`Chr5:4311954`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B52,B94,C7
`Chr5:4311980`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr5:4312062`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	A3,B115,B21,C26,C74
`Chr5:4312062`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	5	A3,B115,B21,C26,C74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764064.1

768 aa

384

768

Inhibitor_I9

Peptidase_S8

fn3_6

PF05922 Inhibitor_I9 27-107 aa PF00082 Peptidase_S8 139-618 aa PF17766 fn3_6 669-763 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764064.1`	Pfam	`PF05922`	Inhibitor_I9	Domain	27	107	6.3e-21	75.6	Peptidase inhibitor I9
`XP_057764064.1`	Pfam	`PF00082`	Peptidase_S8	Domain	139	618	7.5e-39	134.5	Subtilase family
`XP_057764064.1`	Pfam	`PF17766`	fn3_6	Domain	669	763	2.6e-29	102.0	Fibronectin type-III domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908081.1
TTCAAGCATGATGAATAACCGCTCGGCTTATGTTTTATTTGCCTTTCTTCTTCTCCGTGTCTCAGCTTTGTTTGCTCATCAACAGGTATACATAGTGTATTTGGGAGAGCATAGTGGGGATAAGACATTCCAAGAAATCGAAAACACCCACCATTCGTATCTGCATTCTATCAAGTATTCAAAAGAGGAAGCTGCAGCCTCCATTATTCACAGCTACAAGAACGCCATTAATGGCTTCTCCGCCTTGCTCACACCTCAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985237
ATGATGAATAACCGCTCGGCTTATGTTTTATTTGCCTTTCTTCTTCTCCGTGTCTCAGCTTTGTTTGCTCATCAACAGGTATACATAGTGTATTTGGGAGAGCATAGTGGGGATAAGACATTCCAAGAAATCGAAAACACCCACCATTCGTATCTGCATTCTATCAAGTATTCAAAAGAGGAAGCTGCAGCCTCCATTATTCACAGCTACAAGAACGCCATTAATGGCTTCTCCGCCTTGCTCACACCTCAACAAGCTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764064.1
MMNNRSAYVLFAFLLLRVSALFAHQQVYIVYLGEHSGDKTFQEIENTHHSYLHSIKYSKEEAAASIIHSYKNAINGFSALLTPQQAHAISEMDGVVSVFRSEPARLHTTRSWDFISLLEANWDASKANGEELLKKAGYGQNVTVALIDSGIWPESESFSDTDMEPVPAYWKGTCQSGDQFNSSHCNRKIVGARYYVKGYEASYGPLDPKLDFRSPRDINGHGTHTASTVGGRRVPNAAAIGGIGGGTASGGAPLVRLAIY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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