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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000587`

染色体: Chr05 坐标: 4442496-4444238 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000587`
名称	SmilChr05G000587
描述	GDSL esterase/lipase At4g18970-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	4442496 - 4444238 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985284`
GeneID	`130985284`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985284`
原始查询	`SmilChr05G000587`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	GDSL esterase/lipase At4g18970-like
产物	GDSL esterase/lipase At4g18970-like
Arabidopsis	`AT4G18970` (AT4G18970) GDSL-like Lipase/Acylhydrolase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827632] identity=44; qcov=0.926; evalue=1.05e-93; confidence=medium
Rice	`Os01g0748500` (OsGELP25) - identity=46.3; qcov=0.934; evalue=3.95e-103; confidence=high
GO	GO:0016788 (hydrolase activity, acting on ester bonds)
KEGG	-
Pfam	PF00657 (Lipase_GDSL)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985284

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057764171.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764171.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764171.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764171.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057764171.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:4442547`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr5:4442584`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,C5
`Chr5:4442657`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B100,B118,B122
`Chr5:4442657`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	CDS_variant	3	B100,B118,B122
`Chr5:4442678`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B118,B122
`Chr5:4442678`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B118,B122
`Chr5:4442682`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B118
`Chr5:4442682`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B118
`Chr5:4442942`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,B11,C16
`Chr5:4442957`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,C43
`Chr5:4442971`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B37,C32
`Chr5:4442998`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B37,C83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764171.1

363 aa

182

363

Lipase_GDSL

PF00657 Lipase_GDSL 33-332 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764171.1`	Pfam	`PF00657`	Lipase_GDSL	Family	33	332	2.4e-27	97.2	GDSL-like Lipase/Acylhydrolase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908188.1
CACATATTTCCAAATGGCAACTACTACTTTAAAGTGCATAATCCTTGCTATCCTATTTGTTGCTATAACGCCCCAATTGTTAATCCATGCCCAACAAAAAGTTCCTTGCATTTTTCCGTTTGGAGATTCTCTATTCGACAATGGCAACAATAACAACCTACTCACTCTCCTTAAAGCTGATTATTCTCCTTACGGAATTGATTTTGTCTATGGCGTCAATGGCAGGTTCACCAATGGATTTAATATTCCCGATATTCTTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985284
ATGGCAACTACTACTTTAAAGTGCATAATCCTTGCTATCCTATTTGTTGCTATAACGCCCCAATTGTTAATCCATGCCCAACAAAAAGTTCCTTGCATTTTTCCGTTTGGAGATTCTCTATTCGACAATGGCAACAATAACAACCTACTCACTCTCCTTAAAGCTGATTATTCTCCTTACGGAATTGATTTTGTCTATGGCGTCAATGGCAGGTTCACCAATGGATTTAATATTCCCGATATTCTTGCTCAATTGTTAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764171.1
MATTTLKCIILAILFVAITPQLLIHAQQKVPCIFPFGDSLFDNGNNNNLLTLLKADYSPYGIDFVYGVNGRFTNGFNIPDILAQLLGFLNGVPPNRAGGGSNTVLRGVNYASGGAGILDETSLQLGQQIPMNQQLKNHQVNIGRIATILGNQTAADHLLRQCLYTVDMGNSDYVNNYYALPLTLTRILYSPESFAEKLIHEYSQQLTTLYNLQARKVAVFGLQPLGCIPRELFLYPPKGTACVDFINDAVRLFNTKLISL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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