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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000589`

染色体: Chr05 坐标: 4451515-4452674 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000589`
名称	SmilChr05G000589
描述	GDSL esterase/lipase At4g18970-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	4451515 - 4452674 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024804`
GeneID	`131024804`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024804`
原始查询	`SmilChr05G000589`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	GDSL esterase/lipase At4g18970-like
产物	GDSL esterase/lipase At4g18970-like
Arabidopsis	`AT4G18970` (AT4G18970) GDSL-like Lipase/Acylhydrolase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827632] identity=38.1; qcov=1.01; evalue=3.35e-39; confidence=medium
Rice	`Os01g0748500` (OsGELP25) - identity=41.7; qcov=1.01; evalue=6.68e-45; confidence=medium
GO	GO:0016788 (hydrolase activity, acting on ester bonds)
KEGG	-
Pfam	PF00657 (Lipase_GDSL)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024804

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057810323.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810323.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810323.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810323.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057810323.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:4451533`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B38,B39,C13
`Chr5:4451782`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,B69,C38
`Chr5:4451830`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B19
`Chr5:4451830`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B19
`Chr5:4451841`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B19
`Chr5:4451851`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B126,B28,C67
`Chr5:4451882`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,A7
`Chr5:4451908`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,A5
`Chr5:4452104`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	30	A1,A16,A4,B102,B139,B140,B16,B21,B27,B31,B38,B39,B48,B53,B77,B81,B93,B99,C11,C25,C26,C32,C60,C68,C69,C77,C78,C82,C85,C87
`Chr5:4452109`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B18,D2
`Chr5:4452114`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B18,D2
`Chr5:4452136`	`T`	`TTC`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	C15,C76

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810323.1

216 aa

108

216

Lipase_GDSL

PF00657 Lipase_GDSL 41-185 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810323.1`	Pfam	`PF00657`	Lipase_GDSL	Family	41	185	3.6e-10	41.1	GDSL-like Lipase/Acylhydrolase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954340.1
ATGGCCATGCATAAATCTTTAGCATCATCTCTTTCATCAAAATGTCTTTCTCTTTCTTTTACCCTATGGTTTCTTTCAATCAACAACTACTATTCTCTGCCATTAAGCTTGACTAGAATACTAAACTCCCCAGAGAGTTTCGCTGAAAAGTTGATACATGAATATTCTCAGCAACTAACGACTTTGTATAACCTTAAAGCAAGAAAAGTTGCAGTTTTTGGTTTAGCTCCGTTAGGGTGCATTCCTCGAGTGTTGTATCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024804
ATGGCCATGCATAAATCTTTAGCATCATCTCTTTCATCAAAATGTCTTTCTCTTTCTTTTACCCTATGGTTTCTTTCAATCAACAACTACTATTCTCTGCCATTAAGCTTGACTAGAATACTAAACTCCCCAGAGAGTTTCGCTGAAAAGTTGATACATGAATATTCTCAGCAACTAACGACTTTGTATAACCTTAAAGCAAGAAAAGTTGCAGTTTTTGGTTTAGCTCCGTTAGGGTGCATTCCTCGAGTGTTGTATCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810323.1
MAMHKSLASSLSSKCLSLSFTLWFLSINNYYSLPLSLTRILNSPESFAEKLIHEYSQQLTTLYNLKARKVAVFGLAPLGCIPRVLYLYPTNGSTCVEFINNAVRLFNTKLVSLIYNLNNNLSGANFTYINTYNILSGNFATTLGIRVPQAPCCQVNRITGLCVQKGGVCSNRDEYTYFDDYHLTQIVANYTTSRAYIAQTQSDAIPVDIRTLIQLQ

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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