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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000595`

染色体: Chr05 坐标: 4488383-4490668 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000595`
名称	SmilChr05G000595
描述	uncharacterized SmilChr05G000595
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	4488383 - 4490668 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024805`
GeneID	`131024805`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024805`
原始查询	`SmilChr05G000595`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF20167 (Retrotransp-rel)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024805

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057810324.1`
2	Chromosome	染色体	0.80000	`XP_057810324.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810324.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057810324.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057810324.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:4488464`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,B56,B88,B96,C62
`Chr5:4488468`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B117,C65
`Chr5:4488478`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B52,B60,C41,C68
`Chr5:4488480`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A25
`Chr5:4488502`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B117,C65
`Chr5:4488623`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,A2,B136,C27,C9
`Chr5:4489169`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr5:4489279`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,C52
`Chr5:4489324`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A24,B102
`Chr5:4489361`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,B3,B94,C82,D3
`Chr5:4489370`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr5:4489475`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810324.1

649 aa

324

649

Retrotransp-rel

PF20167 Retrotransp-rel 309-479 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810324.1`	Pfam	`PF20167`	Retrotransp-rel	Domain	309	479	4.2e-23	82.9	Putative plant retrotransposon-related domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954341.1
ATGTCTAACCCAAATACTATTGAGCTCATTAGACAGATTCTTTCAAATCCCCAATTTCAAGCAGCCCTAGCCACCATCTCAGTGCCGGAAAATCAGGCTGTTCCACCGTTGCCGTCCCTGCCTGCTCCGATGACAACTCCAGAAACAGCAAGCAGACAAGCTCCACCACCGGTGTCTCAAACGCCGGAAGTCTCAAAAGCGGTGCTGAATCCGGCGCCCATTTCTACAATCGAGCATTCTGCCGATTCACCGGTCGAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024805
ATGTCTAACCCAAATACTATTGAGCTCATTAGACAGATTCTTTCAAATCCCCAATTTCAAGCAGCCCTAGCCACCATCTCAGTGCCGGAAAATCAGGCTGTTCCACCGTTGCCGTCCCTGCCTGCTCCGATGACAACTCCAGAAACAGCAAGCAGACAAGCTCCACCACCGGTGTCTCAAACGCCGGAAGTCTCAAAAGCGGTGCTGAATCCGGCGCCCATTTCTACAATCGAGCATTCTGCCGATTCACCGGTCGAAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810324.1
MSNPNTIELIRQILSNPQFQAALATISVPENQAVPPLPSLPAPMTTPETASRQAPPPVSQTPEVSKAVLNPAPISTIEHSADSPVEKPAKQGEPEKPSIKRKKKGAETSRPKLKAVRRSNRIPTQPRVSKPGPPKMVLLDESEDDAPPAKQARTSGPTVETSTADEESAAPTEETAEPTAPSPAQSLDTLLNEAEAEVAAENPSDDDTLLTEVLTKLKRKAIREGKRKATTSAVPPTPEATESEEEDMDVEDEEPEGSDM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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