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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000597`

染色体: Chr05 坐标: 4497631-4499140 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000597`
名称	SmilChr05G000597
描述	cyclic phosphodiesterase-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	4497631 - 4499140 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985332`
GeneID	`130985332`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985332`
原始查询	`SmilChr05G000597`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cyclic phosphodiesterase-like
产物	cyclic phosphodiesterase-like
Arabidopsis	`AT4G18930` (AT4G18930) RNA ligase/cyclic nucleotide phosphodiesterase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827628] identity=61.5; qcov=0.947; evalue=2.76e-78; confidence=high
Rice	`Os05g0517900` - identity=54.4; qcov=0.952; evalue=3.94e-68; confidence=high
GO	GO:0004113 (2',3'-cyclic-nucleotide 3'-phosphodiesterase activity); GO:0009187 (cyclic nucleotide metabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF07823 (CPDase); PF13563 (2_5_RNA_ligase2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985332

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057764247.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057764247.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764247.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764247.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764247.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:4497954`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B34
`Chr5:4497959`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B34
`Chr5:4497986`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B34
`Chr5:4498217`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,C45
`Chr5:4498996`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B18,C18,C48

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764247.1

189 aa

189

CPDase

2_5_RNA_ligase2

PF07823 CPDase 18-153 aa PF13563 2_5_RNA_ligase2 45-171 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764247.1`	Pfam	`PF07823`	CPDase	Domain	18	153	1.3e-10	42.0	Cyclic phosphodiesterase-like protein
`XP_057764247.1`	Pfam	`PF13563`	2_5_RNA_ligase2	Family	45	171	5.4e-10	40.2	2'-5' RNA ligase superfamily

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908264.1
AAATAATCGAATTTCGAGATCATGGAAAGTCAATACCTCTCGACTCTCGACTCTCGAGTGCACATCTCCACCTCAATAGATACCGTTGCCATTTCCTCAAATCTTCATGGCTACCACCACCACCGCCGACGGCGGAGAAGTCAAGAGAGATACTTATTCGGTGTGGGCGTTTCCGCCGGAGGAATTGAAGCCGCGCCTGAAGAAATTGATGGACGGTCTCAGATCGGAGTTCGGCGGGCCGGAGTTCGAGCCGCACGTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985332
ATGGCTACCACCACCACCGCCGACGGCGGAGAAGTCAAGAGAGATACTTATTCGGTGTGGGCGTTTCCGCCGGAGGAATTGAAGCCGCGCCTGAAGAAATTGATGGACGGTCTCAGATCGGAGTTCGGCGGGCCGGAGTTCGAGCCGCACGTCACGGTGGTCGGAGCTATTAAATTGACGGAGAAAGAGGCGCGTGATATGTTTCACAAGGCGTGCGAGGGCCTCAAACCGTATGCTGCTACGGTGGAGAAAGTCGCAAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764247.1
MATTTTADGGEVKRDTYSVWAFPPEELKPRLKKLMDGLRSEFGGPEFEPHVTVVGAIKLTEKEARDMFHKACEGLKPYAATVEKVATGTFFYQCVFLLLHPTPEVVEASAHSCAHFGLKSSSPYMPHLSLLYGELTDAEKKAAQEKAYALDESIGSLNFQISRLALYKTETEDRTCKSWEKVDEFQLKP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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