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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000603`

染色体: Chr05 坐标: 4534778-4538245 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000603`
名称	SmilChr05G000603
描述	aquaporin NIP1-1-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	4534778 - 4538245 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985311`
GeneID	`130985311`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985311`
原始查询	`SmilChr05G000603`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	aquaporin NIP1-1-like
产物	aquaporin NIP1-1-like
Arabidopsis	`AT4G18910` (NIP1;2) NOD26-like intrinsic protein 1;2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827626] identity=65.4; qcov=1.04; evalue=3.03e-133; confidence=high
Rice	`Os02g0232900` (OsNIP1) - identity=69.5; qcov=0.972; evalue=3.14e-133; confidence=high
GO	GO:0015267 (channel activity); GO:0016020 (membrane); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00230 (MIP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985311

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057764209.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057764209.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057764209.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764209.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764209.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:4534960`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B84,D4
`Chr5:4534999`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B11,C47
`Chr5:4535008`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B23,C59
`Chr5:4535021`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B110
`Chr5:4535046`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B16,B79
`Chr5:4535077`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:4536208`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:4536298`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,B38,B39,B66
`Chr5:4537423`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr5:4537453`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A23,B11,B19,C54,D4
`Chr5:4537480`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A23,B11,B19,C54,D4
`Chr5:4537916`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B87,B88

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764209.1

283 aa

142

283

MIP

PF00230 MIP 43-254 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764209.1`	Pfam	`PF00230`	MIP	Family	43	254	3.3e-66	224.0	Major intrinsic protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908226.1
ATCTCCAAATAAAGGCATCACACTTTCCAACGATATCTCCAAAGACAAATAAATTCTTACAAGTTTAGTGAGTTACATCGACTATTTAAATAATTCCCCAAATAAAAAAAGAAATTAAGAGACCATCTCATTATAGTCATATCCATTGACCCAGCCTCCCTCAACAAAATTCCCACCCCACCTCATGTGCTTGCATAAATAGAGCTTCTAGCTTCTCATAGAATCTCGCTAACTCAAATCTCCTCATACAAAATCAATTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985311
ATGGCTGAGATATTATCCGGTGCAAATGGCAACCACGGAGTGGCGGTGCACATAAAAGACGACGACGATTTCAATCGGAGCTCCCCAGATTCCGACGCCCAAACTTCTACTGGCTGCTGCTCTCTCACTGTCCCCTTCATACAAAAGATAATAGCGGAGACGCTGGGGACATTCTTCTTGATATTCGCCGGTTGCGGCGCGGTGGCGGTGAACGCCGACAAGGAGAAGGTGATAACGCTGCCCGGAATAGCCATAGTGTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764209.1
MAEILSGANGNHGVAVHIKDDDDFNRSSPDSDAQTSTGCCSLTVPFIQKIIAETLGTFFLIFAGCGAVAVNADKEKVITLPGIAIVWGLVVMVMVYSVGHISGAHFNPAVTIAFASCKRFSWKQVPAYIAAQVVGATLAAGTLRLLFSGPHDHFTGTLPTGTHIQSLVVEFIITFYLMFVISGVATDNRAIGELAGLAVGSVILLNVMFAGPISGASMNPARSLGPAIVSNKFDGIWIYLVGPTTGAVAGAWVYNVVRFT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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