当前解析结果
SmilChr05G000605| 统一新 Gene ID | SmilChr05G000605 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G000605 |
| 描述 | BES1/BZR1 homolog protein 4-like |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 4555374 - 4558833 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130985304 |
|---|---|
| GeneID | 130985304 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130985304 |
| 原始查询 | SmilChr05G000605 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | BES1/BZR1 homolog protein 4-like |
| 产物 | BES1/BZR1 homolog protein 4-like |
| Arabidopsis | AT1G78700 (BEH4)BES1/BZR1 homolog 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844206] identity=57.6; qcov=0.961; evalue=5.39e-89; confidence=high |
| Rice | Os06g0552300 (BZR3)- identity=50.5; qcov=0.987; evalue=3.6e-63; confidence=high |
| GO | GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006351 (DNA-templated transcription); GO:0009742 (brassinosteroid mediated signaling pathway) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF05687 (BES1_N) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130985304 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057764196.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057764199.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057764196.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057764196.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057764196.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:4556291 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B71 |
Chr5:4556630 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B38,B39,C24,C75 |
Chr5:4557929 |
C |
CA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 7 | B120,B33,B72,B83,C17,C43,C75 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057764196.1PF05687
BES1_N 4-138 aa
XP_057764197.1PF05687
BES1_N 4-138 aa
XP_057764198.1PF05687
BES1_N 62-128 aa
XP_057764199.1PF05687
BES1_N 57-123 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057764196.1 |
Pfam | PF05687 |
BES1_N | Family | 4 | 138 | 2.2e-60 | 204.1 | BES1/BZR1 plant transcription factor, N-terminal |
XP_057764197.1 |
Pfam | PF05687 |
BES1_N | Family | 4 | 138 | 2.2e-60 | 204.1 | BES1/BZR1 plant transcription factor, N-terminal |
XP_057764198.1 |
Pfam | PF05687 |
BES1_N | Family | 62 | 128 | 1.9e-07 | 32.3 | BES1/BZR1 plant transcription factor, N-terminal |
XP_057764199.1 |
Pfam | PF05687 |
BES1_N | Family | 57 | 123 | 1.8e-07 | 32.4 | BES1/BZR1 plant transcription factor, N-terminal |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
4 records
下载 cDNA FASTA4 records
下载 CDS FASTA4 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。