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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000607`

染色体: Chr05 坐标: 4573761-4574909 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000607`
名称	SmilChr05G000607
描述	transcription repressor OFP5-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	4573761 - 4574909 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024807`
GeneID	`131024807`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024807`
原始查询	`SmilChr05G000607`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription repressor OFP5-like
产物	transcription repressor OFP5-like
Arabidopsis	`AT1G06920` (OFP4) ovate family protein 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837202] identity=49.4; qcov=0.233; evalue=8.3e-23; confidence=weak
Rice	`Os01g0823500` (OsOFP4) - identity=52.6; qcov=0.199; evalue=3.67e-20; confidence=weak
GO	GO:0045892 (negative regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF04844 (Ovate)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024807

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057810325.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057810325.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057810325.1`
4	Cytoskeleton	细胞骨架	0.20000	`XP_057810325.1`
5	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057810325.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:4573805`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:4573882`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A3,C46
`Chr5:4573956`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B16,B62
`Chr5:4573959`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:4573965`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr5:4573991`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B83
`Chr5:4574377`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B77,C86
`Chr5:4574459`	`T`	`TCC`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B23
`Chr5:4574459`	`T`	`TCC`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B23
`Chr5:4574489`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B77,C86
`Chr5:4574664`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B55,C27,C28,C8,C80
`Chr5:4574804`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810325.1

382 aa

191

382

Ovate

PF04844 Ovate 321-377 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810325.1`	Pfam	`PF04844`	Ovate	Family	321	377	3.8e-24	85.2	Transcriptional repressor, ovate

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954342.1
ATGAAATGGGGGAGAAAGACACCTTCACCACCTTCATTTGGTAGCTCAGTCATCACTCGAGTATTCCCAGGTTCTTGGTTTTCTAAGTTCAAACAGACAAGCGGCGGTCTCGACTCTGTTTCAGGGAAGAAGCAACAGAGAGGGAAGCTAGATTTTTCGACTGTGAATTCGTCGTTGCCTGCTGGCTGCAGACAAGGCAGATTCTACAGGTTGGATGATGACGCGTACTGGACACTCTCGTTCCGCAAAGACAGAGGAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024807
ATGAAATGGGGGAGAAAGACACCTTCACCACCTTCATTTGGTAGCTCAGTCATCACTCGAGTATTCCCAGGTTCTTGGTTTTCTAAGTTCAAACAGACAAGCGGCGGTCTCGACTCTGTTTCAGGGAAGAAGCAACAGAGAGGGAAGCTAGATTTTTCGACTGTGAATTCGTCGTTGCCTGCTGGCTGCAGACAAGGCAGATTCTACAGGTTGGATGATGACGCGTACTGGACACTCTCGTTCCGCAAAGACAGAGGAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810325.1
MKWGRKTPSPPSFGSSVITRVFPGSWFSKFKQTSGGLDSVSGKKQQRGKLDFSTVNSSLPAGCRQGRFYRLDDDAYWTLSFRKDRGGGEGKRRNSRINPLWYDSDEEFLVAVSSLSPRRGLETIPEIDTNEMKQERCNGSVLRQKKRDQLKKDNTNVRRSRKLRGRVERKKQAELGTGLHQGEKESSNPEEEQEPTQLQKTDQVKEESYDSAVSNSRNHQNIFFQSSDGEDYQDGKESAATSERVSAFNCQNLENMKIEE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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