当前解析结果
SmilChr05G000611| 统一新 Gene ID | SmilChr05G000611 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G000611 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G000611 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 4602489 - 4605521 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130985344 |
|---|---|
| GeneID | 130985344 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130985344 |
| 原始查询 | SmilChr05G000611 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | Ubiquitin domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841776]; symbol=AT1G53400; hit=AT1G53400; species=arabidopsis; confidence=high |
| 产物 | Ubiquitin domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841776]; symbol=AT1G53400; hit=AT1G53400; species=arabidopsis; confidence=high |
| Arabidopsis | AT1G53400 (AT1G53400)Ubiquitin domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841776] identity=80.9; qcov=0.973; evalue=9.68e-65; confidence=high |
| Rice | Os09g0345000- identity=72.4; qcov=1.03; evalue=8.25e-60; confidence=high |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF16455 (UBD) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130985344 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytosol | 细胞质基质 | 1.00000 | XP_057764264.1 |
| 2 | Cell membrane | 细胞膜 | 1.00000 | XP_057764264.1 |
| 3 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057764264.1 |
| 4 | Ruffle | Ruffle | 0.60000 | XP_057764264.1 |
| 5 | Focal adhesion | Focal adhesion | 0.20000 | XP_057764264.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057764264.1PF16455
UBD 14-112 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057764264.1 |
Pfam | PF16455 |
UBD | Domain | 14 | 112 | 6.7e-39 | 132.9 | Ubiquitin-binding domain |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。