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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000615`

染色体: Chr05 坐标: 4620721-4623096 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000615`
名称	SmilChr05G000615
描述	protein GRAVITROPIC IN THE LIGHT 1-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	4620721 - 4623096 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985269`
GeneID	`130985269`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985269`
原始查询	`SmilChr05G000615`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein GRAVITROPIC IN THE LIGHT 1-like
产物	protein GRAVITROPIC IN THE LIGHT 1-like
Arabidopsis	`AT1G29300` (UNE1) intracellular protein transporter, putative (DUF641) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839804] identity=45.4; qcov=1.03; evalue=1.36e-137; confidence=high
Rice	`Os01g0203800` - identity=39.9; qcov=0.887; evalue=8.57e-78; confidence=medium
GO	GO:0009639 (response to red or far red light); GO:0009959 (negative gravitropism)
KEGG	-
Pfam	PF04859 (DUF641); PF24994 (GIL1_IRKI_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985269

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057764133.1`
2	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057764133.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057764133.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764133.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764133.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:4621234`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,B91
`Chr5:4621357`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B133,B140
`Chr5:4621370`	`TCG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B133,B140
`Chr5:4621370`	`TCG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B133,B140
`Chr5:4621375`	`G`	`GTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	8	A5,B122,B38,B43,B8,C47,C60,D1
`Chr5:4621384`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B43
`Chr5:4621384`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B43
`Chr5:4621385`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	6	B122,B38,B8,C47,C60,D1
`Chr5:4621387`	`GAC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	B122,B38,C47,C60,D1
`Chr5:4621387`	`GAC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	5	B122,B38,C47,C60,D1
`Chr5:4621395`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B122,B43,B8,C63,C74
`Chr5:4621395`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B122,B43,B8,C63,C74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764133.1

450 aa

225

450

DUF641

GIL1_IRKI_C

PF04859 DUF641 64-189 aa PF24994 GIL1_IRKI_C 393-443 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764133.1`	Pfam	`PF04859`	DUF641	Family	64	189	1.2e-41	142.7	Plant protein of unknown function (DUF641)
`XP_057764133.1`	Pfam	`PF24994`	GIL1_IRKI_C	Domain	393	443	2.2e-22	79.5	GIL1/IRKI C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908150.1
ACTAATTGATCGAGTTCCTATATAACGTTTTCTTAAGCCACAATCTTGTTTTATTTAATTATGTTCTATATTTATTATGGCCCATCACTGTAATTTAATTCAAACCCCATTATTCACTAAAATAAATCCCACCTAATTATAATTACTAAAATTTGTATCATATTTTCCTAGGACTATTTTTGTTGAATAGGTAAATTATATCTTAATACATGATATTAAAATAAATAAATCTCCCCATCCCCATTCGAAAAGAAATGATA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985269
ATGGAACCAGCAGCCCGGCCCCGCAGCAGAATCGCCAAAACATTTTCAAGAGTCATCAGCCTCAAATCCGGCTCAAGACACCGCTCCAACCCAGGATTCTGCCTCTTGATCCCTCAAGACAAGCTCCGATGCTGCGAGTCGCATCAATTCGAGGCCGAGGATGCCGACGAAGCCAAGGAGGACTGCAGGAACCGCGCCGCCATGGAAGCCTTCGTCGCCAAGCTCTTCGCCACCATCTCCACCGCTAAGGCCGCCTACGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764133.1
MEPAARPRSRIAKTFSRVISLKSGSRHRSNPGFCLLIPQDKLRCCESHQFEAEDADEAKEDCRNRAAMEAFVAKLFATISTAKAAYAELQMAQFPYNGDAIQCADQSVVDQLKALSELKYAYLKKQIDSSPPHVTLMLAEIQEQQSLMKTYEITMKKMRAEIDAKEARIASLQQQLRESVDSNKSLEKKMNASGSFSILDGVRFSDVSPKDFILVLHYSLRSVRAFVKLLIREMESANWDIDAAANAIHHDVVFGKRDHK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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