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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000642`

染色体: Chr05 坐标: 4862355-4868222 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000642`
名称	SmilChr05G000642
描述	protein LIGHT-DEPENDENT SHORT HYPOCOTYLS 10-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	4862355 - 4868222 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985357`
GeneID	`130985357`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985357`
原始查询	`SmilChr05G000642`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein LIGHT-DEPENDENT SHORT HYPOCOTYLS 10-like
产物	protein LIGHT-DEPENDENT SHORT HYPOCOTYLS 10-like
Arabidopsis	`AT2G42610` (LSH10) LIGHT-DEPENDENT SHORT HYPOCOTYLS-like protein (DUF640) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818861] identity=82.2; qcov=0.738; evalue=1.34e-83; confidence=high
Rice	`Os02g0166800` (OsG1L1) - identity=70.9; qcov=0.825; evalue=6.76e-70; confidence=high
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0009299 (mRNA transcription); GO:0009416 (response to light stimulus)
KEGG	-
Pfam	PF04852 (ALOG_dom)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985357

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057764275.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057764275.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764275.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764275.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057764275.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:4867650`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37
`Chr5:4867806`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr5:4867858`	`A`	`ATG`	2bp_insertion	frameshift_variant	36	A11,A6,A7,B10,B100,B101,B110,B121,B123,B127,B132,B17,B2,B24,B29,B31,B35,B42,B55,B63,B66,B78,B82,B83,B87,B92,B99,C2,C31,C41,C46,C48,C6,C78,C83,D1
`Chr5:4867861`	`GAC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	35	A11,A6,A7,B10,B100,B101,B110,B121,B123,B127,B132,B17,B2,B24,B29,B31,B35,B42,B55,B63,B66,B82,B83,B87,B92,B99,C2,C31,C41,C46,C48,C6,C78,C83,D1
`Chr5:4867967`	`GAT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	8	B29,B35,B55,B66,C31,C78,C83,D1
`Chr5:4867978`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	B29,B35,B55,B66,C31,C78,C83,D1
`Chr5:4867980`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	B29,B35,B55,B66,C31,C78,C83,D1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764275.1

183 aa

183

ALOG_dom

PF04852 ALOG_dom 24-143 aa

XP_057764276.1

183 aa

183

ALOG_dom

PF04852 ALOG_dom 24-143 aa

XP_057764278.1

183 aa

183

ALOG_dom

PF04852 ALOG_dom 24-143 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764275.1`	Pfam	`PF04852`	ALOG_dom	Domain	24	143	4.5e-66	221.5	ALOG domain
`XP_057764276.1`	Pfam	`PF04852`	ALOG_dom	Domain	24	143	4.5e-66	221.5	ALOG domain
`XP_057764278.1`	Pfam	`PF04852`	ALOG_dom	Domain	24	143	4.5e-66	221.5	ALOG domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XR_009088950.1
CTCAATAGACTCAAAAAAATCCTTCTTCGCCATTCCATTTCCATTTCCATTAATATTTTGTTTCACCTTCAATTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTCCAATTACCAAAAGCAGGCATGAATAATTCGAATTCCCCGGCAGGCGTAGGCGGCGCAATGAGCTCGGCGGATCAGGGCTCCGGCAGCAGCAATCCGCCGCTGAGCCGGTACGAGTCGCAGAAGAGAAGGGACTGGAACACCTTCGGGCAGTATCTG...

XM_057908292.1
AGAGTAAGGAAATTAAAATAAAAAATAAAAAAATAAAGCAAGAACAAAAGCACTCCGAAAGGCCCCCACACCATGTCCCCTCAATAGACTCAAAAAAATCCTTCTTCGCCATTCCATTTCCATTTCCATTAATATTTTGTTTCACCTTCAATTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTCCAATTACCAAAAGCAGGCATGAATAATTCGAATTCCCCGGCAGGCGTAGGCGGCGCAATGAGCTCGGCGGATCAGGG...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130985357
ATGAATAATTCGAATTCCCCGGCAGGCGTAGGCGGCGCAATGAGCTCGGCGGATCAGGGCTCCGGCAGCAGCAATCCGCCGCTGAGCCGGTACGAGTCGCAGAAGAGAAGGGACTGGAACACCTTCGGGCAGTATCTGAAGAATCAGAGGCCGCCGGTGTCGCTGTCGCAGTGCAATTGCAACCACGTGCTGGAATTCCTGAGATACCTCGACCAGTTCGGGAAGACGAAGGTTCACCTGCATGGTTGCGTCTTCTTCGG...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057764275.1
MNNSNSPAGVGGAMSSADQGSGSSNPPLSRYESQKRRDWNTFGQYLKNQRPPVSLSQCNCNHVLEFLRYLDQFGKTKVHLHGCVFFGQPDPPAPCTCPLRQAWGSLDALIGRLRAAYEEHGGSPETNPFGNGAIRIYLREVKDCQSKARGIPYKKKKKKRKINQNQTKHDDQLLINNNPKLPA

XP_057764276.1
MNNSNSPAGVGGAMSSADQGSGSSNPPLSRYESQKRRDWNTFGQYLKNQRPPVSLSQCNCNHVLEFLRYLDQFGKTKVHLHGCVFFGQPDPPAPCTCPLRQAWGSLDALIGRLRAAYEEHGGSPETNPFGNGAIRIYLREVKDCQSKARGIPYKKKKKKRKINQNQTKHDDQLLINNNPKLPA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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