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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000655`

染色体: Chr05 坐标: 4936595-4938859 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000655`
名称	SmilChr05G000655
描述	UBP1-associated protein 2C-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	4936595 - 4938859 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985367`
GeneID	`130985367`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985367`
原始查询	`SmilChr05G000655`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	UBP1-associated protein 2C-like
产物	UBP1-associated protein 2C-like
Arabidopsis	`AT3G15010` (AT3G15010) RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820730] identity=49.2; qcov=1.05; evalue=4.92e-105; confidence=high
Rice	`Os01g0614500` - identity=61.7; qcov=0.55; evalue=1.04e-85; confidence=medium
GO	GO:0003723 (RNA binding)
KEGG	smil03040 (Spliceosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00076 (RRM_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985367

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057764291.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.80000	`XP_057764291.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057764291.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764291.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764291.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:4936767`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B53,B71,C29,C6
`Chr5:4936781`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr5:4936784`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr5:4936849`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C23
`Chr5:4936849`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C23
`Chr5:4936858`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B53,B71
`Chr5:4936866`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B53,B71
`Chr5:4936874`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B53,B71,C29,C6
`Chr5:4936891`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr5:4936893`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C2
`Chr5:4936893`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C2
`Chr5:4937107`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B102,B114,B140,B4,C4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764291.1

413 aa

206

413

RRM_1

PF00076 RRM_1 85-153 aa PF00076 RRM_1 178-235 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764291.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	85	153	1.1e-27	96.4	RNA recognition motif
`XP_057764291.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	178	235	1.1e-27	96.4	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908308.1
TAGCCTCCTTATATATCGGCCCCTTCTTACCAGTAGGGTTTTTTCTTGTCACAAACTACTGCAATTAGGGTTCTCTCCGTAAACTCAATTTTTAGTTTGTTAGCCATGGATCTCACCAAAAAACGTAAGGCCGACGAGAACGGCAGAGCGTATCCCTTAACCGCGGACCTCGGAAACCCTTTGGCCGTCGTGCCGCCGTCGTCGATGGGCATCCTTGCCCCCGAAGACGCAGAGAAAATCCTCGAGCCCTTCACCAAGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985367
ATGGATCTCACCAAAAAACGTAAGGCCGACGAGAACGGCAGAGCGTATCCCTTAACCGCGGACCTCGGAAACCCTTTGGCCGTCGTGCCGCCGTCGTCGATGGGCATCCTTGCCCCCGAAGACGCAGAGAAAATCCTCGAGCCCTTCACCAAGGAACAGCTCCTCCCAATTCTACGCGCCGCCGTGCTCCGCCACCCTGATGTTCTGGAGGCTGTGCGCGCCGTCGCCGACGCCGATCCCGTTCAGCGCAAACTGTTCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764291.1
MDLTKKRKADENGRAYPLTADLGNPLAVVPPSSMGILAPEDAEKILEPFTKEQLLPILRAAVLRHPDVLEAVRAVADADPVQRKLFIRGLGWETTTEKLRQVFSAYGELDEANSIVITDKNSGKSKGYGFVTFKHIDAAILALKEANKKIDGRMTVTQLAAAGNSGNSHSSDVALRKIYVGNIPFEISSERLLAHFSMYGEIEEGPLGFDKQTGKAKGFAFFVYKTEEGAKASLVDPMKTIDGHQVVCKLATDNKKQKPN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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