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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000658`

染色体: Chr05 坐标: 4951831-4953529 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000658`
名称	SmilChr05G000658
描述	uncharacterized SmilChr05G000658
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	4951831 - 4953529 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985370`
GeneID	`130985370`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985370`
原始查询	`SmilChr05G000658`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	50S ribosomal protein L34 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839778]; symbol=AT1G29040; hit=AT1G29040; species=arabidopsis; confidence=high
产物	50S ribosomal protein L34 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839778]; symbol=AT1G29040; hit=AT1G29040; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G29040` (AT1G29040) 50S ribosomal protein L34 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839778] identity=66.7; qcov=0.895; evalue=9.65e-78; confidence=high
Rice	`Os01g0613300` - identity=68.2; qcov=0.775; evalue=2.61e-71; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF09585 (Lin0512_fam)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985370

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057764296.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057764296.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764296.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764296.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764296.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:4953059`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C21
`Chr5:4953180`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C20
`Chr5:4953348`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B137,C59

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764296.1

191 aa

191

Lin0512_fam

PF09585 Lin0512_fam 74-189 aa

XP_057764297.1

191 aa

191

Lin0512_fam

PF09585 Lin0512_fam 74-189 aa

XP_057764298.1

191 aa

191

Lin0512_fam

PF09585 Lin0512_fam 74-189 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764296.1`	Pfam	`PF09585`	Lin0512_fam	Family	74	189	1.2e-38	132.4	Conserved hypothetical protein (Lin0512_fam)
`XP_057764297.1`	Pfam	`PF09585`	Lin0512_fam	Family	74	189	1.2e-38	132.4	Conserved hypothetical protein (Lin0512_fam)
`XP_057764298.1`	Pfam	`PF09585`	Lin0512_fam	Family	74	189	1.2e-38	132.4	Conserved hypothetical protein (Lin0512_fam)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908315.1
GGCCCATTTGGATTGAGAGATAAGAAACAGCCCAAAACGCTAAAACTTGGCGGAGAGTTCGAGTTTTGAGCCCAATAATTGCAGCGGAGGTCGTCTTCTTCAGATCACAAGGCAATGACGGCTCTCTTGAGTGGTGGAGTCATTGTGAAGCCCCCAATTCTGTTTTCCCCATCAAGATTTGCTTCCTCCAATTTCCTAACCCCTTCCTTTTCGCATAATAAACCGATTAGTGTTTCACGCCCTTTGAAAGTGGTAGTAGC...

XM_057908313.1
GGCCCATTTGGATTGAGAGATAAGAAACAGCCCAAAACGCTAAAACTTGGCGGAGAGTTCGAGTTTTGAGCCCAATAATTGCAGCGGAGGTCGTCTTCTTCAGATCACAAGGCAATGACGGCTCTCTTGAGTGGTGGAGTCATTGTGAAGCCCCCAATTCTGTTTTCCCCATCAAGATTTGCTTCCTCCAATTTCCTAACCCCTTCCTTTTCGCATAATAAACCGATTAGTGTTTCACGCCCTTTGAAAGTGGTAGTAGC...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130985370
ATGACGGCTCTCTTGAGTGGTGGAGTCATTGTGAAGCCCCCAATTCTGTTTTCCCCATCAAGATTTGCTTCCTCCAATTTCCTAACCCCTTCCTTTTCGCATAATAAACCGATTAGTGTTTCACGCCCTTTGAAAGTGGTAGTAGCTGCTACTCCCATGGCGAGTGAGCAGAGTTCAGTTGAAGCGGCTACCTCTGTGCCCGATTCTTCCATCAAGCTCCTCTTTGTTGAAATGGGAGTCGGCTACGATCAGCATGGGCA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057764296.1
MTALLSGGVIVKPPILFSPSRFASSNFLTPSFSHNKPISVSRPLKVVVAATPMASEQSSVEAATSVPDSSIKLLFVEMGVGYDQHGQDITSAAMRACRDAISSNSIPAFRKGSIPGVSFGEMKLQIKLGVPRPLQHLLDISKVKSVFPYGAITNVEVVDGGLICSSGVEVEEMGDKNDNCYIVNAAVYVGY

XP_057764297.1
MTALLSGGVIVKPPILFSPSRFASSNFLTPSFSHNKPISVSRPLKVVVAATPMASEQSSVEAATSVPDSSIKLLFVEMGVGYDQHGQDITSAAMRACRDAISSNSIPAFRKGSIPGVSFGEMKLQIKLGVPRPLQHLLDISKVKSVFPYGAITNVEVVDGGLICSSGVEVEEMGDKNDNCYIVNAAVYVGY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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