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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000659`

染色体: Chr05 坐标: 4954983-4959498 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000659`
名称	SmilChr05G000659
描述	protein CHUP1, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	4954983 - 4959498 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985368`
GeneID	`130985368`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985368`
原始查询	`SmilChr05G000659`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein CHUP1, chloroplastic-like
产物	protein CHUP1%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT4G18570` (AT4G18570) Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827588] identity=75.9; qcov=0.445; evalue=1.1e-143; confidence=low
Rice	`Os05g0573900` - identity=72.4; qcov=0.376; evalue=1.32e-127; confidence=low
GO	GO:0009658 (chloroplast organization); GO:0009707 (chloroplast outer membrane)
KEGG	-
Pfam	PF26700 (IPGAL1_C); PF30907 (IPGA1_CC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985368

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057764292.1`
2	Cytoskeleton	细胞骨架	0.80000	`XP_057764292.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057764292.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764292.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764292.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:4958188`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C78
`Chr5:4958476`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A13,C36
`Chr5:4958760`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B121,B23
`Chr5:4958916`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764292.1

654 aa

327

654

IPGA1_CC

IPGAL1_C

PF30907 IPGA1_CC 73-163 aa PF26700 IPGAL1_C 485-634 aa

XP_057764294.1

654 aa

327

654

IPGA1_CC

IPGAL1_C

PF30907 IPGA1_CC 73-163 aa PF26700 IPGAL1_C 485-634 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764292.1`	Pfam	`PF30907`	IPGA1_CC	Coiled-coil	73	163	1.5e-31	109.3	IPGA1 coiled-coil
`XP_057764292.1`	Pfam	`PF26700`	IPGAL1_C	Domain	485	634	1.7e-62	210.5	IPGAL1-like, C-terminal domain
`XP_057764294.1`	Pfam	`PF30907`	IPGA1_CC	Coiled-coil	73	163	1.5e-31	109.3	IPGA1 coiled-coil
`XP_057764294.1`	Pfam	`PF26700`	IPGAL1_C	Domain	485	634	1.7e-62	210.5	IPGAL1-like, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908311.1
ATCTTAAATTTATTTTCTAAATTACTCGAAACAAAAGCATTAATTGTACATTTAATCGAAACAGGATCTCAGCGAAAAAGATCCGTTTCTTGACATGGGATCACCCCTTACAAATTAAAGTCTCAAAAAGCTCCTTCCCCAAACGGCCGAACTGTAGCATTTTAGTAATTTTAATTTTAATTTTAATATGAGAAAAGGATGAGAATTCTTCTCTCACTGTCGTTTATTTTTATCAACACTCTGGTACAGTTAGAACAGAA...

XM_057908309.1
ATCTTAAATTTATTTTCTAAATTACTCGAAACAAAAGCATTAATTGTACATTTAATCGAAACAGGATCTCAGCGAAAAAGATCCGTTTCTTGACATGGGATCACCCCTTACAAATTAAAGTCTCAAAAAGCTCCTTCCCCAAACGGCCGAACTGTAGCATTTTAGTAATTTTAATTTTAATTTTAATATGAGAAAAGGATGAGAATTCTTCTCTCACTGTCGTTTATTTTTATCAACACTCTGGTACAGTTAGAACAGAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130985368
ATGGTTGCTGGCAAAGTAAAATCTGTAATGGGGTTGCAGAAATCCGTGGCGCCAACTAAGCAGAAGCCCGACGCCTCCGCCAAACCACCATGGTCAACCACGCCGAGTTCAGCCAAGCCACAGCCGCCGCCGCAGAAGGGATCCGCCGCTCCCTTCTCACGTTACTTCCCACGCGCATCGGCTCAGGTTCAGCCCCGCCCTCCCGACGTCTCCGAACTCCTCCGCCTCGTCGAGGAATTGCGAGAGAGCGAGTCTCGCTT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057764292.1
MVAGKVKSVMGLQKSVAPTKQKPDASAKPPWSTTPSSAKPQPPPQKGSAAPFSRYFPRASAQVQPRPPDVSELLRLVEELRESESRLKTELLEQKLVRESVAMVPVLESVISNKDSEIERSRRKIGCLEAENERLRSENEFLHMELSKQNQIYEEKIRHMQEELADIKIAVSERESDYEESSSSSTTVKLNDAATNNRKSNIPTKCLRKCTAQFSSKYETDARKDEISVATESNERARHPTTGNSDENPETSDVFTGIRA...

XP_057764294.1
MVAGKVKSVMGLQKSVAPTKQKPDASAKPPWSTTPSSAKPQPPPQKGSAAPFSRYFPRASAQVQPRPPDVSELLRLVEELRESESRLKTELLEQKLVRESVAMVPVLESVISNKDSEIERSRRKIGCLEAENERLRSENEFLHMELSKQNQIYEEKIRHMQEELADIKIAVSERESDYEESSSSSTTVKLNDAATNNRKSNIPTKCLRKCTAQFSSKYETDARKDEISVATESNERARHPTTGNSDENPETSDVFTGIRA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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