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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000666`

染色体: Chr05 坐标: 5061662-5063724 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000666`
名称	SmilChr05G000666
描述	adenylate-forming reductase 03009-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	5061662 - 5063724 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985379`
GeneID	`130985379`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985379`
原始查询	`SmilChr05G000666`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	adenylate-forming reductase 03009-like
产物	adenylate-forming reductase 03009-like
Arabidopsis	`AT4G18540` (AT4G18540) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827586] identity=58.4; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0613100` - identity=55.9; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF26733 (03009_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985379

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057764320.1`
2	Vacuole membrane	液泡膜	0.60000	`XP_057764320.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057764320.1`
4	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057764320.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764320.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:5062021`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B21
`Chr5:5062218`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr5:5062221`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,B111,C86,C9
`Chr5:5062266`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	133	A1,A10,A14,A15,A16,A18,A19,A23,B1,B10,B102,B103,B104,B105,B106,B108,B110,B111,B113,B114,B117,B12,B120,B122,B124,B126,B127,B13,B131,B132,B133,B136,B137,B139,B140,B16,B17,B19,B2,B25,B26,B27,B29,B3,B32,B34,B35,B39,B46,B47,B48,B5,B50,B51,B52,B55,B57,B58,B59,B6,B65,B66,B70,B71,B72,B73,B74,B75,B78,B79,B80,B83,B85,B86,B88,B89,B91,B96,B97,C10,C12,C13,C14,C15,C16,C18,C19,C23,C24,C25,C26,C28,C30,C34,C36,C38,C4,C41,C43,C44,C45,C46,C47,C48,C50,C55,C56,C57,C58,C59,C6,C60,C61,C62,C65,C67,C68,C72,C74,C77,C78,C79,C82,C83,C85,C86,C87,D1,D10,D2,D4,D8,D9
`Chr5:5062274`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B103,B120,B59,C14
`Chr5:5062274`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B103,B120,B59,C14
`Chr5:5062283`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1
`Chr5:5062305`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B108,B122
`Chr5:5062305`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B108,B122
`Chr5:5062310`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:5062323`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B139,C85
`Chr5:5062330`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C20,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764320.1

561 aa

280

561

03009_C

PF26733 03009_C 440-561 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764320.1`	Pfam	`PF26733`	03009_C	Domain	440	561	3.7e-41	140.5	Adenylate-forming reductase 03009, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908337.1
TGATGCATGTGGACAAATATGAAACAATGATCATTAGATTCATTATCAAAATATCTTCTGCTTTGAATTTTCACATCAATTAAACTCTCTTCCCTTGCAATCATTCACTACCCAAAACAAAAATCTCCTTTTGCATTCTCTTTGTGATCACTAAACTGCCAAATGAAAAACACTGAAAAATATGGAAGGTTTTCAAGCTGCAGAGGCGTAGCTTTTGAAATAAAACCCCATGCCGACCTCTTCGCTATTCCTGCTCCGGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985379
ATGAAAAACACTGAAAAATATGGAAGGTTTTCAAGCTGCAGAGGCGTAGCTTTTGAAATAAAACCCCATGCCGACCTCTTCGCTATTCCTGCTCCGGTGACTAACCCGCCTCGCAACAGCGGCAGCCGCCGATCTTGGGTTCAGTGGACCACCAGCTTCAGTCGAATTGTTCCATCCTCCGACCTCTTGGAGAGGTCCCTCAGCAGGAGCAGCAGCCATTTCTGCGATCTCGACGACGACGACGATGACGAAGTCGAAAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764320.1
MKNTEKYGRFSSCRGVAFEIKPHADLFAIPAPVTNPPRNSGSRRSWVQWTTSFSRIVPSSDLLERSLSRSSSHFCDLDDDDDDEVETLADIEEGHDEGKPDQSPPPNLLLPRPFSRSDQPPPQSAAKKKSASSRLSVILLDQGLFTVYKRLFVVVLALNITGLVLAATGDFPYARNRAALFSIANIFALVLCRSEAVLRVVFWVAVNVLGYSWVPLRLKTMTTALLQSLGGIHSGCGISSVAWLIYALVLTLQDRDNTSP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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