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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000689`

染色体: Chr05 坐标: 5220252-5224104 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000689`
名称	SmilChr05G000689
描述	sodium/calcium exchanger NCL2-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	5220252 - 5224104 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985401`
GeneID	`130985401`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985401`
原始查询	`SmilChr05G000689`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	sodium/calcium exchanger NCL2-like
产物	sodium/calcium exchanger NCL2-like
Arabidopsis	`AT1G53210` (AT1G53210) sodium/calcium exchanger family protein / calcium-binding EF hand family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841755] identity=37.2; qcov=0.969; evalue=3.24e-106; confidence=medium
Rice	`Os01g0212400` (OsEFCAX1) sodium/calcium exchanger NCL1-like [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:4325568] identity=36.8; qcov=0.974; evalue=5.34e-106; confidence=medium
GO	GO:0005509 (calcium ion binding); GO:0006874 (intracellular calcium ion homeostasis); GO:0015369 (calcium:proton antiporter activity); GO:0016020 (membrane); GO:0070588 (calcium ion transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF13202 (EF-hand_5); PF13499 (EF-hand_7)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985401

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	1.00000	`XP_057764343.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057764343.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.80000	`XP_057764343.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764343.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764343.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:5220943`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B83,C75
`Chr5:5221001`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	16	A1,A22,A25,B124,B128,B31,B34,B62,B67,B92,C21,C54,C59,C7,D2,D9
`Chr5:5221068`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	11	A25,B13,B139,B41,B53,B90,C21,C68,C7,C73,D6
`Chr5:5222140`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B113,C86
`Chr5:5222209`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:5222414`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:5222495`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B105,B113,B16,C30,C47
`Chr5:5222682`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:5222944`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr5:5223165`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A19
`Chr5:5223165`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A19
`Chr5:5223168`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764343.1

541 aa

270

541

EF-hand_7

EF-hand_5

PF13499 EF-hand_7 267-334 aa PF13202 EF-hand_5 269-292 aa PF13202 EF-hand_5 316-331 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764343.1`	Pfam	`PF13499`	EF-hand_7	Domain	267	334	1.6e-12	48.3	EF-hand domain pair
`XP_057764343.1`	Pfam	`PF13202`	EF-hand_5	Domain	269	292	1.5e-07	31.3	EF hand
`XP_057764343.1`	Pfam	`PF13202`	EF-hand_5	Domain	316	331	1.5e-07	31.3	EF hand

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908360.1
ATTACATTTTCTGGTCTTTTCGTGCTTAGCACAGCAAGAAAAATCTGACAAAATTGTATTAAATTATTTACCTGAGTCAGCTAAATTATCACAAACGTGATTTTTCTACCTGCATATCTTTGTCTACGAATACAGTTTAAATATCATATTTTCTAATATTTCCGCCGATAATTTGCTTAAAAATGAGCAAGTTTCCCTTGAACGATAAGTAGGATTCTTGATTGGCACCTGAATATTGGTATTGAATGTTGGAGACTCGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985401
ATGATGGGCATGGCGAAGATGAGCATAACTTGTGTGGTGCTTCTACTTGTGAGCCACGTAGCTCACAGCCGTGTGATTAGGGAGGAGCAGTGGTGGGGTGCGAGCGCGACGGAGACGTGCCAGCCGACTTACGGGTTCTTGCCGTGCTCCAGCAATGTGTGGGGGCTGCTCTTTCTGGTTGTCGTCTTTGAAATCCTGCTCACCTTCGGCGGCCAATACGTCGGCATCGGATCCGACCTCTTCTTCCAAACCATCGGCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764343.1
MMGMAKMSITCVVLLLVSHVAHSRVIREEQWWGASATETCQPTYGFLPCSSNVWGLLFLVVVFEILLTFGGQYVGIGSDLFFQTIGPGIFGASLFQFLGTIPQIVVILVTVLSGSKEAAQERATLGMGLVAGSTVLILTLIWGVAVILASYDLSEAPTIDKSGSQKTTPKGYGIVTDVETSYTARIMLIPLIPFLILLLAQAFSSSSVKRVILLIALIVSVMLLFGFILYQAFQPWIQSRRFEYLMSKYAKDKLLRLLSR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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