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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000692`

染色体: Chr05 坐标: 5236304-5239026 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000692`
名称	SmilChr05G000692
描述	sodium/calcium exchanger NCL1-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	5236304 - 5239026 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985403`
GeneID	`130985403`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985403`
原始查询	`SmilChr05G000692`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	sodium/calcium exchanger NCL1-like
产物	sodium/calcium exchanger NCL1-like
Arabidopsis	`AT1G53210` (AT1G53210) sodium/calcium exchanger family protein / calcium-binding EF hand family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841755] identity=34.9; qcov=1.04; evalue=2.13e-113; confidence=low
Rice	`Os01g0212400` (OsEFCAX1) sodium/calcium exchanger NCL1-like [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:4325568] identity=33.3; qcov=0.96; evalue=6.36e-96; confidence=low
GO	GO:0005509 (calcium ion binding); GO:0006874 (intracellular calcium ion homeostasis); GO:0015369 (calcium:proton antiporter activity); GO:0016020 (membrane); GO:0070588 (calcium ion transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF01699 (Na_Ca_ex); PF13405 (EF-hand_6); PF13499 (EF-hand_7)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985403

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057764345.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057764345.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.40000	`XP_057764345.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764345.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764345.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:5236761`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B113,C80
`Chr5:5236822`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B113,C80
`Chr5:5236867`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B130,B28,C2
`Chr5:5237359`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B107,B51,B87,B88
`Chr5:5237528`	`GTT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	9	B115,B126,B24,B66,B69,B93,C2,C42,C49
`Chr5:5237537`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	114	A1,A10,A15,A16,A2,A20,A22,A23,A5,B10,B104,B106,B108,B109,B11,B110,B111,B112,B114,B121,B122,B126,B127,B129,B133,B137,B14,B140,B16,B17,B2,B25,B27,B28,B30,B31,B33,B35,B37,B38,B40,B42,B43,B45,B46,B5,B50,B52,B54,B56,B59,B6,B60,B62,B65,B67,B69,B70,B73,B75,B78,B8,B9,B92,B94,B96,C1,C11,C13,C14,C16,C18,C22,C24,C26,C28,C29,C3,C31,C33,C34,C35,C39,C4,C40,C43,C44,C45,C47,C49,C5,C52,C6,C61,C63,C64,C65,C66,C67,C69,C7,C74,C76,C77,C79,C8,C80,C82,C83,C84,C86,C9,D11,D3
`Chr5:5237550`	`AAC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	112	A1,A10,A15,A16,A2,A20,A22,A23,A5,B10,B104,B106,B108,B109,B11,B110,B111,B112,B114,B115,B121,B122,B127,B129,B133,B137,B14,B140,B16,B17,B2,B25,B27,B28,B30,B31,B33,B35,B37,B38,B40,B42,B43,B45,B46,B5,B50,B52,B54,B56,B59,B6,B60,B62,B65,B67,B69,B70,B73,B75,B78,B8,B9,B93,B94,B96,C1,C11,C13,C14,C16,C18,C22,C24,C26,C28,C29,C3,C31,C33,C34,C35,C39,C4,C40,C43,C44,C45,C47,C5,C52,C6,C61,C63,C64,C65,C66,C67,C69,C7,C74,C76,C77,C79,C8,C80,C82,C83,C84,C9,D11,D3
`Chr5:5237559`	`G`	`GCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	109	A1,A10,A15,A16,A2,A20,A22,A23,A5,B10,B104,B106,B108,B109,B11,B110,B111,B112,B114,B121,B122,B127,B129,B133,B137,B14,B16,B17,B2,B25,B27,B28,B30,B31,B33,B35,B37,B38,B40,B42,B43,B45,B46,B5,B50,B52,B54,B56,B59,B6,B60,B62,B65,B67,B69,B70,B73,B75,B78,B8,B9,B93,B94,B96,C1,C11,C13,C14,C16,C18,C22,C24,C26,C28,C29,C3,C31,C33,C34,C35,C39,C4,C40,C43,C44,C45,C47,C5,C52,C61,C63,C64,C65,C66,C67,C69,C7,C74,C76,C77,C79,C8,C80,C82,C83,C84,C9,D11,D3
`Chr5:5237561`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C6
`Chr5:5237561`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C6
`Chr5:5237564`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr5:5237618`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,C31

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764345.1

600 aa

300

600

EF-hand_7

EF-hand_6

Na_Ca_ex

PF13499 EF-hand_7 339-405 aa PF13405 EF-hand_6 340-366 aa PF01699 Na_Ca_ex 448-591 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764345.1`	Pfam	`PF13499`	EF-hand_7	Domain	339	405	3.9e-13	50.3	EF-hand domain pair
`XP_057764345.1`	Pfam	`PF13405`	EF-hand_6	Domain	340	366	7.2e-17	60.2	EF-hand domain
`XP_057764345.1`	Pfam	`PF01699`	Na_Ca_ex	Family	448	591	2.6e-08	34.7	Sodium/calcium exchanger protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908362.1
GGCATTCATCTAAGAGGCTGCTATTGGCTTCTCCGCTGGACCTTCATAATGAAAATTTAGTAGTATTAATTGTCTGATTCCCAGTGTTCTTGGATGCAGACATAGAAAATAAGCCAAAATATTCAAGAATTCACATGTAACAACCTATCCAATATATAATGTGCAAGAGCAAAGGTTGTTACTACTACTACTACATGTGATCCAAATTAAGCAGGTTGAGCGTCAATGGCTGCAGTCTCAAAACAGCGCTTGATTTTGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985403
ATGGCTGCAGTCTCAAAACAGCGCTTGATTTTGCTCATCTCACTGATCCACATAGCCGAAGGGCGAGTTCTGAAGCTGTATTCCTCTGATGACGAGTTGATCTCAGACGGAATCGAGAAGCAAGAATCAGCTGCAGGTTGCAGCCACCAGTATGGTTTCCTGCCCTGTGCAGAAAACGCGGCTGGTTACATTTTCCTGATAGTGGTGTATCAGGTGCTTCTGGTGGTCGGAGGAAGGCTGATAAGCAGCGGGAGCGAGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764345.1
MAAVSKQRLILLISLIHIAEGRVLKLYSSDDELISDGIEKQESAAGCSHQYGFLPCAENAAGYIFLIVVYQVLLVVGGRLISSGSEMLLHITGAGKFGGIIFRILMVLPSMMFMILSGIFSSKEGAQSQVAVGVSIYAGITVFSLTIQWGMCMIYGKIDLNTTPNASPSKILKDTGVKIDDKTSYTAGVMLLSLIPYVVLQLVFFVNTLSGERIITLTAFIISSLSLLSYAAYQIWDPWMQERSLRYSQFLDLFDKNDDG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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