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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000694`

染色体: Chr05 坐标: 5241604-5244728 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000694`
名称	SmilChr05G000694
描述	nudix hydrolase 15, mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	5241604 - 5244728 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985405`
GeneID	`130985405`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985405`
原始查询	`SmilChr05G000694`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nudix hydrolase 15, mitochondrial-like
产物	nudix hydrolase 15%2C mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT1G28960` (NUDX15) nudix hydrolase homolog 15 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839773] identity=73.2; qcov=0.844; evalue=5.6e-133; confidence=high
Rice	`Os08g0375900` (OJ1705_C03.104-1) - identity=64.5; qcov=0.654; evalue=5.02e-90; confidence=high
GO	GO:0003986 (acetyl-CoA hydrolase activity); GO:0010945 (coenzyme A diphosphatase activity); GO:0015938 (coenzyme A catabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF00293 (NUDIX)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985405

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057764348.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.40000	`XP_057764347.1`
3	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.20000	`XP_057764348.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764347.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764347.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:5242478`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr5:5242571`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	16	A19,A25,B10,B119,B3,B46,B77,C17,C27,C28,C29,C33,C34,C40,C50,C72
`Chr5:5242687`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B3,C83
`Chr5:5242687`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B3,C83
`Chr5:5242722`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C68
`Chr5:5243686`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr5:5244169`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B101,C59
`Chr5:5244232`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C35,C38
`Chr5:5244341`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr5:5244413`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,A20
`Chr5:5244526`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C35,C38

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764347.1

334 aa

167

334

NUDIX

PF00293 NUDIX 108-186 aa

XP_057764348.1

301 aa

150

301

NUDIX

PF00293 NUDIX 108-188 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764347.1`	Pfam	`PF00293`	NUDIX	Domain	108	186	9.9e-13	49.0	NUDIX domain
`XP_057764348.1`	Pfam	`PF00293`	NUDIX	Domain	108	188	5e-13	49.9	NUDIX domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

5 records

下载 cDNA FASTA

XR_009088960.1
AGTTTAAAATTTGCAATGGGATAGAAGTAGAACCAGAAGTAGCAAAAAGAGGGTTTTGTGGGTAGCCAATTATTGATTTCATATACAAAATTACATTAAATAGAAGTGGAGGGATATACATATAGGCCGTAGAGTAGTGTAATTAGATGCATTGATACATGAAATAATTTTATGGCCGATTTATCGACGGCCATTTATGCAGCTAGTACACATGCTCCCATTACTCAGAAGAACCTCAACCTCCTTATTTCCCTCAATAT...

XR_009088961.1
GCAATGGGATAGAAGTAGAACCAGAAGTAGCAAAAAGAGGGTTTTGTGGGTAGCCAATTATTGATTTCATATACAAAATTACATTAAATAGAAGTGGAGGGATATACATATAGGCCGTAGAGTAGTGTAATTAGATGCATTGATACATGAAATAATTTTATGGCCGATTTATCGACGGCCATTTATGCAGCTAGTACACATGCTCCCATTACTCAGAAGAACCTCAACCTCCTTATTTCCCTCAATATTGTCATCCCTAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130985405
ATGCAGCTAGTACACATGCTCCCATTACTCAGAAGAACCTCAACCTCCTTATTTCCCTCAATATTGTCATCCCTAACCCCTCCATCCTCGTCTCCACTCCCAATTTCTCTCTCTAAATTCATCATCATGGAAACCCACAATTCTGGGAGACTCGTGGTTTTGGCCCAACAATTGCGCCTGTACAAGCCGCCGCCGACATCGGATGACGACGAGGAGGAGCAGAGGATGGAGGAGAGTGCAGAGAAAGTGGTTGCGCAAGT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057764347.1
MQLVHMLPLLRRTSTSLFPSILSSLTPPSSSPLPISLSKFIIMETHNSGRLVVLAQQLRLYKPPPTSDDDEEEQRMEESAEKVVAQVGFAESATSVAQVRPAERFRPKRAAVLICLFEGDNGEFRVILTKRSSQLSTHSGEVSLPGGKAEETDANDAETATREAKEEIGLDPSLVNVITCLEPFLSKHLLRVIPVIGILSNKKDFNPSPNAAEVEVVFDAPLEMFLKVFSKVLCFLFSFHSRYLFSSCSCYTLDRYLQFQ...

XP_057764348.1
MQLVHMLPLLRRTSTSLFPSILSSLTPPSSSPLPISLSKFIIMETHNSGRLVVLAQQLRLYKPPPTSDDDEEEQRMEESAEKVVAQVGFAESATSVAQVRPAERFRPKRAAVLICLFEGDNGEFRVILTKRSSQLSTHSGEVSLPGGKAEETDANDAETATREAKEEIGLDPSLVNVITCLEPFLSKHLLRVIPVIGILSNKKDFNPSPNAAEVEVVFDAPLEMFLKDENRRCEERVWMGDKYLIHYFDYEINDKKYVIW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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