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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000714`

染色体: Chr05 坐标: 5419459-5421503 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000714`
名称	SmilChr05G000714
描述	adenylate-forming reductase 03009-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	5419459 - 5421503 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985425`
GeneID	`130985425`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985425`
原始查询	`SmilChr05G000714`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	adenylate-forming reductase 03009-like
产物	adenylate-forming reductase 03009-like
Arabidopsis	`AT4G18540` (AT4G18540) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827586] identity=58.1; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0613100` - identity=55.7; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF26733 (03009_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985425

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole membrane	液泡膜	0.60000	`XP_057764377.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057764377.1`
3	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057764377.1`
4	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057764377.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764377.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:5420125`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,C6,D3
`Chr5:5420171`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A3
`Chr5:5420354`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58
`Chr5:5420527`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr5:5420610`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,B132,B65,D7
`Chr5:5420622`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	A7,B132,B65,D7
`Chr5:5420622`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,B132,B65,D7
`Chr5:5420626`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr5:5420632`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,B132,B65,D7
`Chr5:5420634`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,B132,B65,D7
`Chr5:5420640`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A7,B65
`Chr5:5420678`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,B132,B65,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764377.1

561 aa

280

561

03009_C

PF26733 03009_C 440-561 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764377.1`	Pfam	`PF26733`	03009_C	Domain	440	561	3.7e-41	140.5	Adenylate-forming reductase 03009, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908394.1
AAATATGAAACAATGATCATTAGATTCATTATCAAAATATCTTCTGCTTTGAATTTTCACATCAATTAAACTCTCTTCCCTTGCAATCATTCACTACCCAAAACAAAAATCTCCTTTGGCATTCTCTTTGTGATCACTAAACTGCCAAATGAAAAACACTGAAAAATATGGAAGGTTTTCAAGCTGCAGAGGCGTAGCTTTTGAAATAAAACCCCATGCCGACCTCTTCGCTATTCCTGCTCCGGTGACTAACCCGCCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985425
ATGAAAAACACTGAAAAATATGGAAGGTTTTCAAGCTGCAGAGGCGTAGCTTTTGAAATAAAACCCCATGCCGACCTCTTCGCTATTCCTGCTCCGGTGACTAACCCGCCTCGCAACAGCGGCAGCCGCCGATCTTGGGTTCAGTGGACCACCAGCTTCAGTCGAATTGTTCCATCCTCCGACCTCTTGGAGAGGTCCCTCAGCAGGAGCAGCAGCCATTTCTGCGATCTCGACGACGACGACGATGACGAAGTCGAAAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764377.1
MKNTEKYGRFSSCRGVAFEIKPHADLFAIPAPVTNPPRNSGSRRSWVQWTTSFSRIVPSSDLLERSLSRSSSHFCDLDDDDDDEVETLADIEEGHDEGKPDQSPPPNLLLPRPFSRSDQPPPPSAAKKKSASSRLSVILLDQGLFTVYKRLFVVVLALNITGLVLAATGDFPYARNRAALFSIANIFALVLCRSEAVLRVVFWVAVNVLGYSWVPLLLKTMTTALLQSLGGIHSGCGISSAAWLIYALVLTLKDRDNTSP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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