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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000726`

染色体: Chr05 坐标: 5554124-5556756 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000726`
名称	SmilChr05G000726
描述	replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit D-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	5554124 - 5556756 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985438`
GeneID	`130985438`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985438`
原始查询	`SmilChr05G000726`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit D-like
产物	replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit D-like
Arabidopsis	`AT5G61000` (RPA70D) Replication factor-A protein 1-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836221] identity=29.4; qcov=0.461; evalue=1.62e-07; confidence=low
Rice	`Os03g0214100` (OsRPA1) - identity=24.7; qcov=0.705; evalue=3.66e-10; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF08646 (Rep_fac-A_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985438

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057764403.1`
2	Chromosome	染色体	0.80000	`XP_057764403.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764403.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057764403.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057764403.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变，或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764403.1

258 aa

129

258

Rep_fac-A_C

PF08646 Rep_fac-A_C 66-200 aa

XP_057764404.1

258 aa

129

258

Rep_fac-A_C

PF08646 Rep_fac-A_C 66-200 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764403.1`	Pfam	`PF08646`	Rep_fac-A_C	Domain	66	200	2.2e-11	44.5	Replication factor-A C terminal domain
`XP_057764404.1`	Pfam	`PF08646`	Rep_fac-A_C	Domain	66	200	2.2e-11	44.5	Replication factor-A C terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908421.1
ATAAAATAAAATACAGATTAAAAGTGAATAAATAATTGGTGATAGATAGTTAGGCTTTGATAAAATACAATGATATAATTGTTTTGCTACCATATCAATATGTTTATATTTATTTGATTAGAGTTATACTTATAATTATTATTAACATTCCTTTTTGTTGTTGTTTGTTTATTATTATTTATTATTGTCGAGTTATATTACGTTAAATGAGATGTTATATATACATAATTTTATTATTTTTATTGTAGGATATATAATAT...

XM_057908420.1
ATAAAATAAAATACAGATTAAAAGTGAATAAATAATTGGTGATAGATAGTTAGGCTTTGATAAAATACAATGATATAATTGTTTTGCTACCATATCAATATGTTTATATTTATTTGATTAGAGTTATACTTATAATTATTATTAACATTCCTTTTTGTTGTTGTTTGTTTATTATTATTTATTATTGTCGAGTTATATTACGTTAAATGAGATGTTATATATACATAATTTTATTATTTTTATTGTAGGATATATAATAT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130985438
ATGAGATCCGTCTTGCAAATTACACCAACATGCAAAGAGATCCAGCTGATCCAATCGTGTTCTGATGTTGATGATGATGCATTAGCAATTGCTAAATTAGCAATGGCACAAAAAATAAAACAAGCAAAGGAAATCACTCTTAAAGATCTCAGAGACAATCAACATTTATTATCAGAGGGTGTTTCGTATTGTTTTACGGGAATTATCGACAAAGTTGAAAATAAAGCAACAATATGGTATGATTCTTGTAAAAATTGCAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057764403.1
MRSVLQITPTCKEIQLIQSCSDVDDDALAIAKLAMAQKIKQAKEITLKDLRDNQHLLSEGVSYCFTGIIDKVENKATIWYDSCKNCNTSFSKIDESAICKKCNEEVLETSPRYRITINVIQGDCNARITLFGQVAEVYVGCSVDEYLSSIKEGETESTYYRRLSTQAYTEMRFMTMLKSIKFDQRGNLNIVANAIEKMEPMESIDVGDIEEELTEVEEKKHSPEKTKKKIPSRKKTNYDGVAAHRIAKEKKKDNQEKV

XP_057764404.1
MRSVLQITPTCKEIQLIQSCSDVDDDALAIAKLAMAQKIKQAKEITLKDLRDNQHLLSEGVSYCFTGIIDKVENKATIWYDSCKNCNTSFSKIDESAICKKCNEEVLETSPRYRITINVIQGDCNARITLFGQVAEVYVGCSVDEYLSSIKEGETESTYYRRLSTQAYTEMRFMTMLKSIKFDQRGNLNIVANAIEKMEPMESIDVGDIEEELTEVEEKKHSPEKTKKKIPSRKKTNYDGVAAHRIAKEKKKDNQEKV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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