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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000733`

染色体: Chr05 坐标: 5588925-5592244 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000733`
名称	SmilChr05G000733
描述	uncharacterized SmilChr05G000733
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	5588925 - 5592244 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985445`
GeneID	`130985445`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985445`
原始查询	`SmilChr05G000733`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0752800; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os01g0752800; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G46020` (AT5G46020) 28 kDa heat/acid-stable phosphoprotein-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834642] identity=67.1; qcov=1.02; evalue=9.46e-52; confidence=high
Rice	`Os01g0752800` - identity=71.7; qcov=1.04; evalue=9.62e-73; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0005829 (cytosol)
KEGG	-
Pfam	PF10252 (PP28)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985445

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057764411.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.80000	`XP_057764411.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057764412.1`
4	Nucleolus	核仁	0.20000	`XP_057764411.1`
5	Nucleolar fibrillar center	Nucleolar fibrillar center	0.20000	`XP_057764411.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:5589219`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B103,C12,C35,C82
`Chr5:5589221`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	9	B118,B21,B31,B40,C1,C45,C51,C57,C80
`Chr5:5589236`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	44	A14,A18,A25,A4,A8,B10,B106,B121,B127,B135,B136,B138,B19,B2,B32,B48,B49,B50,B55,B59,B6,B62,B63,B75,B78,B95,C15,C19,C21,C22,C31,C44,C51,C52,C55,C62,C67,C70,C74,C76,C83,C84,C9,D8
`Chr5:5589268`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A15,B88

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764411.1

167 aa

167

PP28

PF10252 PP28 72-149 aa

XP_057764412.1

160 aa

160

PP28

PF10252 PP28 72-149 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764411.1`	Pfam	`PF10252`	PP28	Domain	72	149	3.6e-29	101.7	Casein kinase substrate phosphoprotein PP28
`XP_057764412.1`	Pfam	`PF10252`	PP28	Domain	72	149	5.8e-29	101.0	Casein kinase substrate phosphoprotein PP28

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908429.1
GCTTTTACCAAAATAAAGCTGTGAACCGGACAGAACTAAACCGAAGGTTGAAATTTTCATTCTTCGCAAAGTAGTCTGACGGGCCCGCATATCAGATTCTCACATTCCCAACTAGGGTTTATGAAAAGGGGCCAGAATCTGATTCAGCAAAGGAGCCCTCTCAAAAATCAATTTTATCGAATCTGCTCTCCCCGATAAGAGAGTCGCAAATTATCCCCTTTAAGCGATTACAAGCAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG...

XM_057908428.1
GCTTTTACCAAAATAAAGCTGTGAACCGGACAGAACTAAACCGAAGGTTGAAATTTTCATTCTTCGCAAAGTAGTCTGACGGGCCCGCATATCAGATTCTCACATTCCCAACTAGGGTTTATGAAAAGGGGCCAGAATCTGATTCAGCAAAGGAGCCCTCTCAAAAATCAATTTTATCGAATCTGCTCTCCCCGATAAGAGAGTCGCAAATTATCCCCTTTAAGCGATTACAAGCAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130985445
ATGGGGAGAGGGAAGTTCAAGGGCAAGCCGACGGGCCGCCGCCATTTCTCCACCCCTGAAGAGATGATTGCTGGTAGCTCTGCTCGTCCTCGTACTTTCAGAAAGGAAGTAGCTGATGTTGTAGAAGATGAGACTTCTGATGTAGAGTCAGAAGAGGAATCTGAGGGCGAACCTGAAAAAGCAAAAGGTGCCGAGGGGGTCATTCAGATTGAAAATCCTAACCTGGTAAAGCCAAAGAACTTGAAAGCACGTGATGCTGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057764411.1
MGRGKFKGKPTGRRHFSTPEEMIAGSSARPRTFRKEVADVVEDETSDVESEEESEGEPEKAKGAEGVIQIENPNLVKPKNLKARDADLEKTSELSRREREEIEKQKAHERYMRLQEQGKTDQAKKDLERLALIRQQRAEAAKKREEEKAGNLLILISIFFPWSLTCR

XP_057764412.1
MGRGKFKGKPTGRRHFSTPEEMIAGSSARPRTFRKEVADVVEDETSDVESEEESEGEPEKAKGAEGVIQIENPNLVKPKNLKARDADLEKTSELSRREREEIEKQKAHERYMRLQEQGKTDQAKKDLERLALIRQQRAEAAKKREEEKAAKEQKKVEGRK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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