当前解析结果
SmilChr05G000761| 统一新 Gene ID | SmilChr05G000761 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G000761 |
| 描述 | protein NUCLEAR FUSION DEFECTIVE 6, mitochondrial-like |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 5895155 - 5898721 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130985475 |
|---|---|
| GeneID | 130985475 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130985475 |
| 原始查询 | SmilChr05G000761 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | protein NUCLEAR FUSION DEFECTIVE 6, mitochondrial-like |
| 产物 | protein NUCLEAR FUSION DEFECTIVE 6%2C mitochondrial-like |
| Arabidopsis | AT2G33847 (AT2G33847)uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:5007926] identity=53.9; qcov=1.01; evalue=1.38e-21; confidence=medium |
| Rice | Os01g0754000- identity=43.5; qcov=1.02; evalue=4.9e-11; confidence=low |
| GO | GO:0005739 (mitochondrion) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130985475 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Mitochondrion | 线粒体 | 1.00000 | XP_057764445.1 |
| 2 | Mitochondrion membrane | 线粒体膜 | 0.60000 | XP_057764445.1 |
| 3 | Mitochondrion inner membrane | 线粒体内膜 | 0.40000 | XP_057764445.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057764445.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057764445.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:5895326 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B23 |
Chr5:5895589 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C12,C78 |
Chr5:5895618 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B16 |
Chr5:5895619 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B137,C73 |
Chr5:5895621 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B137 |
Chr5:5895651 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B71,C62 |
Chr5:5897682 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C61 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
4 records
下载 cDNA FASTA4 records
下载 CDS FASTA4 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。