当前解析结果
SmilChr05G000770| 统一新 Gene ID | SmilChr05G000770 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G000770 |
| 描述 | dormancy-associated protein 1 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 6004898 - 6005865 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130985485 |
|---|---|
| GeneID | 130985485 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130985485 |
| 原始查询 | SmilChr05G000770 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | dormancy-associated protein 1 |
| 产物 | dormancy-associated protein 1 |
| Arabidopsis | AT1G28330 (DYL1)dormancy-associated protein-like 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839729] identity=64.8; qcov=1.05; evalue=1.15e-46; confidence=medium |
| Rice | Os11g0671000 (ARP1)- identity=58.4; qcov=1.08; evalue=6.15e-35; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF05564 (Auxin_repressed) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130985485 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057764463.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.40000 | XP_057764463.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057764463.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057764463.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057764463.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057764463.1PF05564
Auxin_repressed 7-116 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057764463.1 |
Pfam | PF05564 |
Auxin_repressed | Family | 7 | 116 | 2e-49 | 167.8 | Dormancy/auxin associated protein |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。