当前解析结果
SmilChr05G000783| 统一新 Gene ID | SmilChr05G000783 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G000783 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G000783 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 6106539 - 6108073 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130985499 |
|---|---|
| GeneID | 130985499 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130985499 |
| 原始查询 | SmilChr05G000783 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839719]; symbol=AT1G28250; hit=AT1G28250; species=arabidopsis; confidence=medium |
| 产物 | uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839719]; symbol=AT1G28250; hit=AT1G28250; species=arabidopsis; confidence=medium |
| Arabidopsis | AT1G28250 (AT1G28250)uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839719] identity=63.9; qcov=0.882; evalue=5.67e-39; confidence=medium |
| Rice | Os07g0299600- identity=54.1; qcov=0.773; evalue=2.06e-21; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130985499 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 1.00000 | XP_057764482.1 |
| 2 | Endoplasmic reticulum membrane | 内质网膜 | 1.00000 | XP_057764482.1 |
| 3 | Golgi apparatus | 高尔基体 | 0.20000 | XP_057764482.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057764483.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057764483.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:6106985 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B104,C12 |
Chr5:6107077 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B111 |
Chr5:6107455 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr5:6107577 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C12 |
Chr5:6107885 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C74,D2 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。