当前解析结果
SmilChr05G000786| 统一新 Gene ID | SmilChr05G000786 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G000786 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G000786 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 6140027 - 6141116 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130985501 |
|---|---|
| GeneID | 130985501 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130985501 |
| 原始查询 | SmilChr05G000786 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | GO:0008270 (zinc ion binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130985501 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 1.00000 | XP_057764485.1 |
| 2 | Endoplasmic reticulum membrane | 内质网膜 | 1.00000 | XP_057764485.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.20000 | XP_057764485.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057764485.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057764485.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:6140085 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A24,B139,B21,B27,B89 |
Chr5:6140116 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B94 |
Chr5:6140187 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A18,B60,B75 |
Chr5:6140201 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B79,C53 |
Chr5:6140261 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A2,B35,B7,B99,C83 |
Chr5:6140269 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | B94 |
Chr5:6140269 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B94 |
Chr5:6140280 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B94 |
Chr5:6140288 |
C |
CT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 73 | A1,A2,A21,A22,A3,A5,A7,B10,B100,B102,B106,B110,B117,B120,B125,B126,B127,B128,B132,B135,B14,B15,B18,B26,B32,B36,B40,B45,B47,B5,B53,B6,B61,B64,B67,B69,B71,B72,B74,B77,B79,B80,B85,B86,B91,B96,C11,C16,C19,C2,C25,C27,C34,C37,C38,C40,C41,C44,C46,C47,C50,C53,C56,C57,C58,C73,C75,C78,C79,C84,C85,D5,D7 |
Chr5:6140302 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B108,B12,B60 |
Chr5:6140320 |
TC |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | A9 |
Chr5:6140320 |
TC |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | A9 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。