当前解析结果
SmilChr05G000788| 统一新 Gene ID | SmilChr05G000788 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G000788 |
| 描述 | non-classical arabinogalactan protein 31 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 6150259 - 6151386 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130985504 |
|---|---|
| GeneID | 130985504 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130985504 |
| 原始查询 | SmilChr05G000788 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | non-classical arabinogalactan protein 31 |
| 产物 | non-classical arabinogalactan protein 31 |
| Arabidopsis | AT2G34700 (AT2G34700)Pollen Ole e 1 allergen and extensin family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818035] identity=47.2; qcov=0.558; evalue=1.53e-37; confidence=medium |
| Rice | Os01g0726100- identity=42.9; qcov=0.326; evalue=1.71e-15; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130985504 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cell wall | 细胞壁 | 1.00000 | XP_057764486.1 |
| 2 | Secreted | 分泌到胞外 | 0.20000 | XP_057764486.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057764486.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057764486.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057764486.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:6150445 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B11 |
Chr5:6150490 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B106 |
Chr5:6150508 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B111 |
Chr5:6150512 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B80 |
Chr5:6150556 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C41 |
Chr5:6150564 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C36 |
Chr5:6150581 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B100,C35,C36 |
Chr5:6150643 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B104,B111,C12,C19,D1 |
Chr5:6150713 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B13,B33,B35,D4 |
Chr5:6150849 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B11 |
Chr5:6150853 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B1,B2,B21,C8 |
Chr5:6150880 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B83,C10 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。