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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000789`

染色体: Chr05 坐标: 6171582-6172192 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000789`
名称	SmilChr05G000789
描述	uncharacterized SmilChr05G000789
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	6171582 - 6172192 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025458`
GeneID	`131025458`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025458`
原始查询	`SmilChr05G000789`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Protein kinase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834170]; symbol=AT5G41680; hit=AT5G41680; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Protein kinase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834170]; symbol=AT5G41680; hit=AT5G41680; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G41680` (AT5G41680) Protein kinase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834170] identity=44.3; qcov=0.459; evalue=8.45e-15; confidence=low
Rice	`Os01g0223600` - identity=39.6; qcov=0.645; evalue=1.88e-14; confidence=low
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025458

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057811233.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057811233.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057811233.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057811233.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811233.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:6171587`	`CCA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	6	B103,B2,C2,C21,C25,C35
`Chr5:6171597`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B11,C69
`Chr5:6171610`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	30	A23,A4,B102,B105,B112,B118,B121,B128,B13,B25,B31,B33,B41,B42,B43,B58,B59,B70,B94,B98,C22,C24,C29,C35,C39,C46,C49,C61,C71,C82
`Chr5:6171612`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B131,B47
`Chr5:6171612`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B131,B47
`Chr5:6171631`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr5:6171760`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	127	A1,A13,A14,A15,A16,A20,A24,A25,A3,A4,A5,A6,A8,A9,B101,B106,B108,B109,B114,B117,B120,B122,B123,B124,B125,B132,B133,B135,B136,B137,B139,B14,B140,B15,B17,B18,B19,B2,B23,B24,B28,B29,B32,B35,B36,B37,B38,B39,B4,B40,B41,B44,B46,B48,B5,B52,B53,B56,B57,B58,B60,B61,B62,B67,B68,B7,B73,B75,B80,B82,B83,B85,B87,B9,B91,B93,B94,B95,B96,B98,C1,C13,C14,C15,C21,C24,C25,C27,C29,C31,C33,C34,C36,C37,C38,C39,C41,C43,C48,C5,C50,C51,C52,C56,C59,C6,C61,C62,C65,C67,C7,C71,C72,C75,C80,C81,C83,C84,C86,D1,D10,D11,D2,D6,D7,D8,D9
`Chr5:6171770`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B25,B37,C1
`Chr5:6171770`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B25,B37,C1
`Chr5:6171772`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A25,B129,C12
`Chr5:6171782`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A25,B129,C12
`Chr5:6171823`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B13,B33,B35,C67,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955250.1
ATGTCTAGGAATTACGACAACAGGGAGAGGCTGGTGGCGGCGGTGGTGAAGAGAGAGCAGATTTGGAAACTCTGTCATCAAGATTCTATCTCCACCATCTGCGCCTCTGACTACTCATCAGATCTAGAATTGGGTTTGCCACTTTCACTTGGGAGCTTCCACATTACTGCTACTTTCGATTTGGTTCAACACCTCAACTATGGGAAAACGGATCTGGTTCAACTGTTGCGGGATGTGCAGGTGTCGGACCAACAATGTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025458
ATGTCTAGGAATTACGACAACAGGGAGAGGCTGGTGGCGGCGGTGGTGAAGAGAGAGCAGATTTGGAAACTCTGTCATCAAGATTCTATCTCCACCATCTGCGCCTCTGACTACTCATCAGATCTAGAATTGGGTTTGCCACTTTCACTTGGGAGCTTCCACATTACTGCTACTTTCGATTTGGTTCAACACCTCAACTATGGGAAAACGGATCTGGTTCAACTGTTGCGGGATGTGCAGGTGTCGGACCAACAATGTTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811233.1
MSRNYDNRERLVAAVVKREQIWKLCHQDSISTICASDYSSDLELGLPLSLGSFHITATFDLVQHLNYGKTDLVQLLRDVQVSDQQCFRSGSRAVIKLMDTASITKYEFEQHMIVLRDCKHENVATPWAYHLSEERKLMVYDYYSQGSVFDMFRGNGSRPDWESRVRIAERVA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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