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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000798`

染色体: Chr05 坐标: 6243621-6244747 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000798`
名称	SmilChr05G000798
描述	CASP-like protein 1C1
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	6243621 - 6244747 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985513`
GeneID	`130985513`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985513`
原始查询	`SmilChr05G000798`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	CASP-like protein 1C1
产物	CASP-like protein 1C1
Arabidopsis	`AT1G03700` (AT1G03700) Uncharacterized protein family (UPF0497) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839428] identity=44.2; qcov=0.738; evalue=1.53e-49; confidence=medium
Rice	`Os05g0245300` (OsBLE3) - identity=42.2; qcov=0.643; evalue=3.21e-31; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04535 (CASP_dom)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985513

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057764497.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057764497.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764497.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764497.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764497.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:6243851`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	112	A1,A10,A11,A14,A16,A19,A2,A20,A21,A23,A3,A7,B1,B106,B109,B11,B119,B120,B123,B125,B126,B127,B128,B130,B132,B134,B136,B137,B139,B14,B15,B18,B20,B27,B3,B31,B35,B36,B41,B42,B45,B51,B54,B58,B60,B67,B68,B7,B75,B76,B78,B79,B80,B81,B86,B87,B90,B91,B93,B94,B96,B98,C1,C11,C12,C13,C15,C16,C19,C20,C23,C24,C26,C27,C31,C32,C33,C34,C36,C38,C39,C4,C40,C42,C49,C5,C50,C52,C53,C55,C56,C59,C6,C60,C63,C65,C68,C69,C72,C73,C75,C76,C79,C8,C82,C85,C86,D1,D10,D3,D5,D7
`Chr5:6243856`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	112	A1,A10,A11,A14,A16,A19,A2,A20,A21,A23,A3,A7,B1,B106,B109,B11,B119,B120,B123,B125,B126,B127,B128,B130,B132,B134,B136,B137,B139,B14,B15,B18,B20,B27,B3,B31,B35,B36,B41,B42,B45,B51,B54,B58,B60,B67,B68,B7,B75,B76,B78,B79,B80,B81,B86,B87,B90,B91,B93,B94,B96,B98,C1,C11,C12,C13,C15,C16,C19,C20,C23,C24,C26,C27,C31,C32,C33,C34,C36,C38,C39,C4,C40,C42,C49,C5,C50,C52,C53,C55,C56,C59,C6,C60,C63,C65,C68,C69,C72,C73,C75,C76,C79,C8,C82,C85,C86,D1,D10,D3,D5,D7
`Chr5:6244465`	`G`	`GGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C61
`Chr5:6244465`	`G`	`GGT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C61
`Chr5:6244468`	`TTA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	54	A15,A5,B100,B106,B108,B11,B110,B120,B131,B132,B134,B22,B23,B25,B33,B4,B44,B45,B51,B59,B6,B64,B65,B71,B73,B76,B78,B82,B83,B9,B91,B98,C10,C12,C13,C16,C22,C23,C26,C30,C38,C4,C40,C45,C47,C50,C52,C53,C59,C71,C75,C76,C83,C84
`Chr5:6244503`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	90	A16,A19,A21,A22,A7,A9,B107,B109,B111,B113,B114,B115,B118,B12,B122,B123,B124,B125,B128,B13,B132,B133,B136,B137,B138,B139,B14,B140,B17,B20,B21,B23,B30,B32,B33,B36,B37,B38,B39,B45,B50,B56,B57,B61,B62,B66,B70,B72,B73,B74,B8,B80,B90,B92,B94,B96,B99,C1,C11,C18,C19,C24,C31,C32,C34,C35,C38,C43,C46,C5,C50,C52,C58,C61,C62,C63,C64,C66,C68,C69,C7,C70,C73,C74,C75,C80,C82,D11,D5,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764497.1

221 aa

110

221

CASP_dom

PF04535 CASP_dom 68-199 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764497.1`	Pfam	`PF04535`	CASP_dom	Domain	68	199	1.2e-36	126.4	Casparian strip membrane protein domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908514.1
ATTAACGCTAATATAAATCTTCATGACACAACCCTCAATAATTCAAACAACACGTAATTAATTTTTAAATACACCGTAACTAAGTATGGTAATAATTTAAAAGGAGAAAATATTGGGGAGTTCACGAAAACGCCCCAAATGGCGTAACATATGGGGTGGCTACCATTAGGTTACCTAGAGATTGACCCTCCAACTCAAAATATAAACTCCCACTCATCTGCCTTTCCTAACTCATCTTCTCCTTCTTTAATATCCACACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985513
ATGGGGTGGCTACCATTAGGTTACCTAGAGATTGACCCTCCAACTCAAAATATAAACTCCCACTCATCTGCCTTTCCTAACTCATCTTCTCCTTCTTTAATATCCACACAAATCTTACCAAAAAAAATAAAACCATTAAAATTTTTGTTGCAACAAGAAGCAGTGAAAGCTAGTATGAGTTTGTCCAAGAACATCCCAATCTTGGTGCTGAGGCTGGTGGCGTTGGCAGCCTCCGTTTCAGCAACGGCGGTGATGGTCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764497.1
MGWLPLGYLEIDPPTQNINSHSSAFPNSSSPSLISTQILPKKIKPLKFLLQQEAVKASMSLSKNIPILVLRLVALAASVSATAVMVTSNDSATVFNMKFEAKYTNSPTFKYFVLMNAVAAGYSLILLFFPSKNSCGHFILVLDLMILVLLDSSISACLAIGQVGKKGNSHAGWLPICDQVPKFCDHVTGAMVAAFAALLAYFLILLYSIHNLMNLFTLTNT

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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