当前解析结果
SmilChr05G000799| 统一新 Gene ID | SmilChr05G000799 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G000799 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G000799 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 6245975 - 6249229 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130985514 |
|---|---|
| GeneID | 130985514 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130985514 |
| 原始查询 | SmilChr05G000799 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | DNA ligase-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:2745578]; symbol=AT2G33793; hit=AT2G33793; species=arabidopsis; confidence=high |
| 产物 | DNA ligase-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:2745578]; symbol=AT2G33793; hit=AT2G33793; species=arabidopsis; confidence=high |
| Arabidopsis | AT2G33793 (AT2G33793)DNA ligase-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:2745578] identity=59.4; qcov=1.01; evalue=7.09e-81; confidence=high |
| Rice | Os03g0837800 (OSJNBa0042I09.19)- identity=49.5; qcov=0.938; evalue=4.75e-54; confidence=high |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130985514 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057764498.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 1.00000 | XP_057764498.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 1.00000 | XP_057764498.1 |
| 4 | Cytoskeleton | 细胞骨架 | 0.40000 | XP_057764498.1 |
| 5 | Spindle | Spindle | 0.40000 | XP_057764498.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:6246142 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B132,B45,C38 |
Chr5:6246773 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr5:6247842 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A2,A24,D3 |
Chr5:6247892 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A3 |
Chr5:6248057 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B126,B24,B93,B98 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。