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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000800`

染色体: Chr05 坐标: 6270256-6271073 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000800`
名称	SmilChr05G000800
描述	E3 ubiquitin-protein ligase RMA1H1-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	6270256 - 6271073 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985516`
GeneID	`130985516`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985516`
原始查询	`SmilChr05G000800`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	E3 ubiquitin-protein ligase RMA1H1-like
产物	E3 ubiquitin-protein ligase RMA1H1-like
Arabidopsis	`AT4G03510` (RMA1) RING membrane-anchor 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825654] identity=41.6; qcov=0.948; evalue=1.57e-45; confidence=medium
Rice	`Os04g0530500` (OsRDCP1) - identity=38; qcov=0.961; evalue=9.27e-37; confidence=medium
GO	GO:0005783 (endoplasmic reticulum); GO:0006511 (ubiquitin-dependent protein catabolic process); GO:0044390 (ubiquitin-like protein conjugating enzyme binding); GO:0046872 (metal ion binding); GO:0061630 (ubiquitin protein ligase activity); GO:0071712 (GO:0071712)
KEGG	smil04141 (Protein processing in endoplasmic reticulum - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00097 (zf-C3HC4); PF13445 (zf-RING_UBOX); PF13639 (zf-RING_2); PF13920 (zf-C3HC4_3); PF13923 (zf-C3HC4_2); PF15227 (zf-C3HC4_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985516

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057764501.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.80000	`XP_057764501.1`
3	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057764501.1`
4	Lipid droplet	脂滴	0.20000	`XP_057764501.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764501.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:6270324`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:6270670`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr5:6270683`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,B47
`Chr5:6270824`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B59
`Chr5:6270824`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B59

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764501.1

233 aa

116

233

zf-RING_2

zf-C3HC4_3

zf-C3HC4_2

zf-RING_UBOX

zf-C3HC4

zf-C3HC4_4

PF13639 zf-RING_2 29-77 aa PF13920 zf-C3HC4_3 29-82 aa PF13923 zf-C3HC4_2 30-62 aa PF13445 zf-RING_UBOX 30-74 aa PF00097 zf-C3HC4 30-76 aa PF15227 zf-C3HC4_4 30-76 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764501.1`	Pfam	`PF13639`	zf-RING_2	Domain	29	77	2e-09	38.3	Ring finger domain
`XP_057764501.1`	Pfam	`PF13920`	zf-C3HC4_3	Domain	29	82	5.2e-07	30.1	Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)
`XP_057764501.1`	Pfam	`PF13923`	zf-C3HC4_2	Domain	30	62	5.5e-09	36.4	Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)
`XP_057764501.1`	Pfam	`PF13445`	zf-RING_UBOX	Domain	30	74	4.6e-10	40.1	RING-type zinc-finger
`XP_057764501.1`	Pfam	`PF00097`	zf-C3HC4	Domain	30	76	1.5e-11	44.7	Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)
`XP_057764501.1`	Pfam	`PF15227`	zf-C3HC4_4	Domain	30	76	6.4e-08	33.3	zinc finger of C3HC4-type, RING

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908518.1
ATGGCATTTCAGCAGTACTTTATGCAGGGATGGGAATCTCTTCCTCAGCCATCCACAGAATCCGAGAAGACTTCTGCTTGCTTCGATTGCAGCATATGTTTAGACTTTGCCCGCGATCCAGTGGTAACCCTCTGCGGCCATCTTTACTGTTGGCCCTGCATATACAAGTGGTTCGACTCCCAAAGTTCGTCCCTTGGTTCAGACGAGCGTCCTCAGTGCCCCGTTTGCAAGGCCGAGATATCTGAGAAGACAATGGTCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985516
ATGGCATTTCAGCAGTACTTTATGCAGGGATGGGAATCTCTTCCTCAGCCATCCACAGAATCCGAGAAGACTTCTGCTTGCTTCGATTGCAGCATATGTTTAGACTTTGCCCGCGATCCAGTGGTAACCCTCTGCGGCCATCTTTACTGTTGGCCCTGCATATACAAGTGGTTCGACTCCCAAAGTTCGTCCCTTGGTTCAGACGAGCGTCCTCAGTGCCCCGTTTGCAAGGCCGAGATATCTGAGAAGACAATGGTCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764501.1
MAFQQYFMQGWESLPQPSTESEKTSACFDCSICLDFARDPVVTLCGHLYCWPCIYKWFDSQSSSLGSDERPQCPVCKAEISEKTMVPLYGRGKSLSEAGPEGKVIPPRPPACGIRGLADLFSPDQQLPSPSRENRHDFPNAHASYGEDSSPQLFNLGGTAAVSLSHPTIGMFGEMVYARVFGNSQSLYTYPNSYHTVVSRSPRLRRQELQADKSLNRVTIFLFCFFLLCLLVF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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