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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000803`

染色体: Chr05 坐标: 6282806-6285049 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000803`
名称	SmilChr05G000803
描述	pentatricopeptide repeat-containing protein At4g21705, mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	6282806 - 6285049 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985519`
GeneID	`130985519`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985519`
原始查询	`SmilChr05G000803`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pentatricopeptide repeat-containing protein At4g21705, mitochondrial-like
产物	pentatricopeptide repeat-containing protein At4g21705%2C mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT4G21705` (AT4G21705) Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828258] identity=47.2; qcov=0.972; evalue=4.49e-157; confidence=high
Rice	`Os07g0598500` - identity=41; qcov=0.887; evalue=3.34e-123; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0005739 (mitochondrion)
KEGG	-
Pfam	PF01535 (PPR); PF13812 (PPR_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985519

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057764505.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764505.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764505.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764505.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057764505.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:6283031`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C66
`Chr5:6283080`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113
`Chr5:6283252`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B125,B21,D8
`Chr5:6283746`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B114,D1
`Chr5:6283965`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C41,D4
`Chr5:6283975`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B14,D1
`Chr5:6283989`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A22,B136,B139,B140,B80
`Chr5:6284036`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B122
`Chr5:6284036`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B122
`Chr5:6284415`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38
`Chr5:6284576`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B111,C19
`Chr5:6284625`	`T`	`TGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	7	A8,B131,B47,B65,B67,B89,C76

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764505.1

495 aa

248

495

PPR

PPR_3

PPR

PF01535 PPR 134-160 aa PF13812 PPR_3 152-210 aa PF01535 PPR 167-195 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764505.1`	Pfam	`PF01535`	PPR	Repeat	134	160	1.1e-15	57.3	PPR repeat
`XP_057764505.1`	Pfam	`PF13812`	PPR_3	Repeat	152	210	1.5e-09	38.5	Pentatricopeptide repeat domain
`XP_057764505.1`	Pfam	`PF01535`	PPR	Repeat	167	195	1.1e-15	57.3	PPR repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908522.1
TGGAATCAAGAAAAATAAATGAACCTCAGCTTACTAAATGGAGCTTAGTGAATTATCGTTTTCTTTAGACTTTAGTCCTTTGGGATTTCTCTTATTACTGTTTCAGCCCCTCCCCAAAATCATAAACCCTTCCAAAAACCCTCTCAACGAACTCTGTTCTTTCCTAATTAAATTCCTCTTTCGTCAATCGAAAGGAACGGGAGTCGATTAAATCCGAAATGCTATCGCGTAGAAACCCTTTCAAATCCCTAATTGATACC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985519
ATGCTATCGCGTAGAAACCCTTTCAAATCCCTAATTGATACCTACATTATCAGCAGGCGATGTTACCACGCGAACAGCAACAATTCACTGTACGCCAAAATCAGTCCCCTGGGAAACCCTAGCACCAATGTCACTCCCGAGCTCGATAAATGGGTTGGCACCGGAAAAATCCGATTCGCCGAGCTTCAGCGCATTATTATCGATCTCCGTAGGCGCAAACGTTTCGGTCAAGCTCTCCAGGTTTCTGAGTGGATGAGAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764505.1
MLSRRNPFKSLIDTYIISRRCYHANSNNSLYAKISPLGNPSTNVTPELDKWVGTGKKXRFAELQRIIIDLRRRKRFGQALQVSEWMRGRGVYTFTPVEHAVQLDLIGKVHGFLHAESYFNSLTEQDKTDKVHGALLHCYARQRETERALALLKTIRDKGLPLSSLAFNDIMCLHASTDEIDKVPEVLKQMKEDGVQPDNLSYRICINSFGVRSDIEGLERVLNEMENDAHITMDWNTYAVVANFYVKAGLNYKANIYLQK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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