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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000808`

染色体: Chr05 坐标: 6309546-6310751 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000808`
名称	SmilChr05G000808
描述	stem-specific protein TSJT1-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	6309546 - 6310751 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985525`
GeneID	`130985525`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985525`
原始查询	`SmilChr05G000808`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	stem-specific protein TSJT1-like
产物	stem-specific protein TSJT1-like
Arabidopsis	`AT4G27450` (AT4G27450) aluminum induced protein with YGL and LRDR motifs [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828854] identity=42.5; qcov=1; evalue=1.07e-70; confidence=medium
Rice	`Os04g0679400` - identity=41.1; qcov=1; evalue=6.27e-62; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF12481 (DUF3700); PF13522 (GATase_6); PF13537 (GATase_7)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985525

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057764510.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057764510.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057764510.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764510.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764510.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:6309707`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B113,C61
`Chr5:6310334`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C47,D11
`Chr5:6310339`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B86,C27,C28
`Chr5:6310412`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,B16,B36,B93
`Chr5:6310610`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B103,C24,C49
`Chr5:6310610`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B103,C24,C49
`Chr5:6310726`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764510.1

252 aa

126

252

DUF3700

GATase_7

GATase_6

PF12481 DUF3700 2-223 aa PF13537 GATase_7 76-166 aa PF13522 GATase_6 77-180 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764510.1`	Pfam	`PF12481`	DUF3700	Domain	2	223	3.3e-86	289.2	Aluminium induced protein
`XP_057764510.1`	Pfam	`PF13537`	GATase_7	Domain	76	166	4.8e-10	40.2	Glutamine amidotransferase domain
`XP_057764510.1`	Pfam	`PF13522`	GATase_6	Domain	77	180	1.5e-08	35.0	Glutamine amidotransferase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908527.1
GGTTAGTTCATCTTCACATTATGTTGGCAGTTTTTGAGAAATCAGTTTCGAAGCCACCCAAGGAGCTGAGCCTGAGCCTTCCAGTTGCTGGGAGGAATTGCTTGAACAGATGGGAAGAAATCGCAGAAATCTTCCGATCATGGAGATCAGACTGCACCTTTTACCACCTATCCGGTGGCAACTTCCTGGCTTTGTCGCATCAAGATGAAAATCCAGCAATTCCAAGGTCTGTTGTAGTGATGGATGATATCTTCTGCATA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985525
ATGTTGGCAGTTTTTGAGAAATCAGTTTCGAAGCCACCCAAGGAGCTGAGCCTGAGCCTTCCAGTTGCTGGGAGGAATTGCTTGAACAGATGGGAAGAAATCGCAGAAATCTTCCGATCATGGAGATCAGACTGCACCTTTTACCACCTATCCGGTGGCAACTTCCTGGCTTTGTCGCATCAAGATGAAAATCCAGCAATTCCAAGGTCTGTTGTAGTGATGGATGATATCTTCTGCATATTCTCCGGGGCGTTGCACAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764510.1
MLAVFEKSVSKPPKELSLSLPVAGRNCLNRWEEIAEIFRSWRSDCTFYHLSGGNFLALSHQDENPAIPRSVVVMDDIFCIFSGALHNTCDMRRYYGLSRQATEAVIVVEAYKVLRDRAPYPTDQVVKELDGKFAFILFDSKAPTLFLARDRDGSVQLYWGVAGDGSLVCTDDPNVISAACDKHYTPFPPGCVFMDRNGLMSFDHPLNKVRGVVREDDGGVIFQVDLYSRIPSIPRSGSAVNWANAAQVEGDY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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