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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000810`

染色体: Chr05 坐标: 6317022-6321287 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000810`
名称	SmilChr05G000810
描述	allantoinase
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	6317022 - 6321287 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985524`
GeneID	`130985524`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985524`
原始查询	`SmilChr05G000810`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	allantoinase
产物	allantoinase
Arabidopsis	`AT4G04955` (ALN) allantoinase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825836] identity=71.3; qcov=0.921; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0680400` (OsALN) - identity=62.5; qcov=0.534; evalue=8.2e-116; confidence=medium
GO	GO:0000256 (allantoin catabolic process); GO:0004038 (allantoinase activity); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006145 (purine nucleobase catabolic process); GO:0008270 (zinc ion binding); GO:0050897 (cobalt ion binding)
KEGG	smil00230 (Purine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01979 (Amidohydro_1); PF12890 (DHOase); PF24890 (ALN_composite)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985524

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057764509.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057764509.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057764509.1`
4	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057764509.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764509.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:6317265`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B19,B42,B43,B62
`Chr5:6317299`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B106,B48
`Chr5:6317491`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A4,B138,C2,C43
`Chr5:6317545`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr5:6317592`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A16
`Chr5:6317595`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B21,B88
`Chr5:6317837`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr5:6318318`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,B112,C54
`Chr5:6318718`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B14,D11
`Chr5:6318738`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B120,C53
`Chr5:6318760`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,B140
`Chr5:6319373`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,B106,B17

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764509.1

504 aa

252

504

ALN_composite

DHOase

Amidohydro_1

PF24890 ALN_composite 42-95 aa PF12890 DHOase 96-271 aa PF01979 Amidohydro_1 96-487 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764509.1`	Pfam	`PF24890`	ALN_composite	Domain	42	95	3.6e-27	94.8	Allantoinase, composite domain
`XP_057764509.1`	Pfam	`PF12890`	DHOase	Family	96	271	8.6e-09	36.2	Dihydro-orotase-like
`XP_057764509.1`	Pfam	`PF01979`	Amidohydro_1	Domain	96	487	6.5e-28	98.7	Amidohydrolase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908526.1
ACAAAGATCTACCTCACTATTTTGAAAAAATAGATTTTTTAATTATTAAATATATAAAAAAGATCTATATACTCTTATTTTTTGTTTTTTGTATTTTTGTGAATTTCAGTGGGCCCAACGCTCTCTACCCCAGTCCGGCCCTGATCCAGACTGATACAAAACATACATACAGCAGAGAGAGGGAGAGAGAGAGAGTGTGTGGCAGCTCACATGGAGTCTGGGAAATTGAGGCTTCTTGCTCTGCTGCCAATTCTTGCATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985524
ATGGAGTCTGGGAAATTGAGGCTTCTTGCTCTGCTGCCAATTCTTGCATCACTCCTTCTACTCTGTTCCGATAGTCTTCCGCAGTTTGTTCGACAAGCCAAGCGAATCAACTGCAGCCATGTACAGCAAAGGCATTACTGGATAGCTAGCAAGCGTATTGTGACGCCAAATGCAATTGTTTCTGGTGCAGTTGAAGTGAAAGACGGAAAGATTCTAGCTGTTGTTGAGGGAGATGACTGGCGTGGGAATGCTTGGACTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764509.1
MESGKLRLLALLPILASLLLLCSDSLPQFVRQAKRINCSHVQQRHYWIASKRIVTPNAIVSGAVEVKDGKILAVVEGDDWRGNAWTHQIIDYGEAVVMPGLIDVHAHLDDPGRTEWEGFPSGTMAAAAGGITTLIDMPLNSYPSTVSEETLKLKIKAAQGRIFVDVGFWGGLVPENAFNSTALERLLEAGALGLKSFMCPSGINDFPMTNSSHIKEGLSVLAKYGRPLLVHAEIEQEPQGLVMADANPRSYSTYLKTRPA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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