当前解析结果
SmilChr05G000815| 统一新 Gene ID | SmilChr05G000815 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G000815 |
| 描述 | glycine-rich cell wall structural protein |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 6373000 - 6373649 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130985531 |
|---|---|
| GeneID | 130985531 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130985531 |
| 原始查询 | SmilChr05G000815 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | glycine-rich cell wall structural protein |
| 产物 | glycine-rich cell wall structural protein |
| Arabidopsis | AT4G21620 (AT4G21620)glycine-rich protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828249] identity=75.4; qcov=0.449; evalue=8.41e-16; confidence=low |
| Rice | Os03g0676300- identity=84.5; qcov=0.457; evalue=6.7e-17; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130985531 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Secreted | 分泌到胞外 | 1.00000 | XP_057764529.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057764529.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057764529.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057764529.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057764529.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:6373116 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr5:6373144 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B112,C54 |
Chr5:6373170 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A14,A25,B127,C55 |
Chr5:6373179 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B105,B16,C30 |
Chr5:6373228 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B115,B20,C58,C62,C80 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。