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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000846`

染色体: Chr05 坐标: 6682825-6684999 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000846`
名称	SmilChr05G000846
描述	uncharacterized SmilChr05G000846
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	6682825 - 6684999 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985558`
GeneID	`130985558`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985558`
原始查询	`SmilChr05G000846`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os10g0498200; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os10g0498200; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G51000` (AT3G51000) alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824264] identity=37.3; qcov=1.01; evalue=3.46e-67; confidence=medium
Rice	`Os10g0498200` - identity=53.4; qcov=0.99; evalue=1.59e-120; confidence=high
GO	GO:0016787 (hydrolase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00561 (Abhydrolase_1); PF12146 (Hydrolase_4); PF12697 (Abhydrolase_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985558

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057764569.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057764569.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057764569.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764569.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764569.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:6683018`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr5:6683059`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,B73,B94
`Chr5:6683164`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B40,B57,C20,C61
`Chr5:6683956`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,B105,D9
`Chr5:6684012`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,C24,C49
`Chr5:6684026`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B115,B20,C62,C80
`Chr5:6684052`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D11
`Chr5:6684052`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D11
`Chr5:6684144`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B46
`Chr5:6684144`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B46
`Chr5:6684218`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	14	A7,A9,B123,B133,B66,B90,B92,C1,C20,C32,C58,C64,C66,C68
`Chr5:6684553`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764569.1

312 aa

156

312

Abhydrolase_1

Hydrolase_4

Abhydrolase_6

PF00561 Abhydrolase_1 27-293 aa PF12146 Hydrolase_4 28-135 aa PF12697 Abhydrolase_6 29-300 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764569.1`	Pfam	`PF00561`	Abhydrolase_1	Domain	27	293	9.4e-27	94.9	alpha/beta hydrolase fold
`XP_057764569.1`	Pfam	`PF12146`	Hydrolase_4	Domain	28	135	6.2e-11	42.8	Serine aminopeptidase, S33
`XP_057764569.1`	Pfam	`PF12697`	Abhydrolase_6	Domain	29	300	1.2e-15	59.5	Alpha/beta hydrolase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908586.1
GAATTATTTATAGATGACACTACTTAACACTAATAATACTGTTCATTTTTATGTAAATTCGAGTTAGTTGGTTGTTCACTCTAATCAAATCACTAGAATCGTAATAACCCAAAGTTTGAAATTCTCAAATGCTAATTGCCCCAAAATATAGCGAGCAAGTTCCTCTAAAGCAGCGAAAATGGAAGAGATAGAACACAAGTACACCGAAGTCAACGGGCTGAAACTTCACACGGCGGAAATCGGAAGCGTCTCTTCGCCGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985558
ATGGAAGAGATAGAACACAAGTACACCGAAGTCAACGGGCTGAAACTTCACACGGCGGAAATCGGAAGCGTCTCTTCGCCGGCGGTGGTTTTCCTACACGGATTTCCGGAAATATGGTACTCCTGGCGACACCAGATGATCGCCGTCGCCAAGGGCGGTTTCAGAGCCATCGCACCCGATTACAGAGGATACGGGCTATCCGACCCGCCGCCCCGACCCGACGAAACCACATTCTCGGATCTCATAGCTGATCTCCTTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764569.1
MEEIEHKYTEVNGLKLHTAEIGSVSSPAVVFLHGFPEIWYSWRHQMIAVAKGGFRAIAPDYRGYGLSDPPPRPDETTFSDLIADLLALIDSLNLSKVILVGKDFGSRIVYLFSLLHPLRVAGFITLGVPFIPPNRPSVVKLHCEGSYISRWQERGRAEADFSRFDTRTVVRNIYILFSRSQVPTALENQEVMDIVDSSTPLPPWFTEQDLDIYASLYEKSGFQTALQVPYRSLKEEFDIANVKVEVPALVIMGGKDYSLN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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