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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000849`

染色体: Chr05 坐标: 6693085-6696395 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000849`
名称	SmilChr05G000849
描述	4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate reductase 1, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	6693085 - 6696395 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985559`
GeneID	`130985559`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985559`
原始查询	`SmilChr05G000849`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate reductase 1, chloroplastic-like
产物	4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate reductase 1%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT3G59890` (AT3G59890) Dihydrodipicolinate reductase, bacterial/plant [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825159] identity=75; qcov=0.793; evalue=3.42e-160; confidence=high
Rice	`Os02g0436400` (DAPB1) - identity=67.8; qcov=0.894; evalue=1.13e-149; confidence=high
GO	GO:0008839 (4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate reductase activity); GO:0009089 (GO:0009089); GO:0009570 (chloroplast stroma); GO:0019877 (GO:0019877); GO:0070402 (NADPH binding)
KEGG	smil00261 (Monobactam biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00300 (Lysine biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01230 (Biosynthesis of amino acids - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01113 (DapB_N); PF05173 (DapB_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985559

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057764570.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057764570.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764570.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764570.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764570.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:6693217`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B109,B37
`Chr5:6693609`	`AGT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	83	A1,A10,A11,A14,A16,A2,A25,A5,B100,B101,B105,B107,B110,B113,B115,B118,B12,B120,B122,B124,B126,B127,B13,B20,B24,B25,B28,B3,B30,B38,B39,B4,B40,B46,B50,B52,B54,B56,B58,B6,B66,B68,B69,B7,B70,B73,B76,B80,B87,B88,B90,B92,B93,B94,B96,B97,B98,C16,C18,C21,C29,C32,C33,C45,C48,C54,C55,C56,C59,C62,C63,C65,C68,C7,C70,C71,C76,C80,C82,C83,D10,D8,D9
`Chr5:6693613`	`T`	`TGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	83	A1,A10,A11,A14,A16,A2,A25,A5,B100,B101,B105,B107,B110,B113,B115,B118,B12,B120,B122,B124,B126,B127,B13,B20,B24,B25,B28,B3,B30,B38,B39,B4,B40,B46,B50,B52,B54,B56,B58,B6,B66,B68,B69,B7,B70,B73,B76,B80,B87,B88,B90,B92,B93,B94,B96,B97,B98,C16,C18,C21,C29,C32,C33,C45,C48,C54,C55,C56,C59,C62,C63,C65,C68,C7,C70,C71,C76,C80,C82,C83,D10,D8,D9
`Chr5:6694190`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B56,B96,C61
`Chr5:6694592`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B27
`Chr5:6696045`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B27

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764570.1

348 aa

174

348

DapB_N

DapB_C

PF01113 DapB_N 75-198 aa PF05173 DapB_C 202-342 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764570.1`	Pfam	`PF01113`	DapB_N	Domain	75	198	6.2e-16	59.3	Dihydrodipicolinate reductase, N-terminus
`XP_057764570.1`	Pfam	`PF05173`	DapB_C	Domain	202	342	9.2e-16	58.7	Dihydrodipicolinate reductase, C-terminus

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908587.1
AAGTAGACTTAATTTTTCGTGAAGAGTACCATTTAACGGGTGCAAATGTCACTGAGTTGTAAAAGGATTGCGAAATCATTGTATACTCGTCTTAAACCCTAAGCCATCCGCTACCTCGTGGTGCTCAGCTCAGCCGTTGTTCCCCTGTCACCGCCGAGCTCCGTCTTCATAGCTTCCTTGCAGAGTCCAGCCGAAGCTGTACTGTTTCTTTTTGTAAAAAATTTATCAGGAATTATCGCGAGATTATCGAATCCTATTTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985559
ATGGCATTTGTTGCTAGAGCCTCGTTAAATACCAGCTACACAACTTGGAGAGAACACATTAATCTGCTAAATCCGTGCTCTGAGTTGAGAATTGAGAAAACGTTTGGTAATCGATTAAGTAGCAGAACTCCCATTCCGCGAAAATCTCTTGTTGCAGTGGCGAGCAACTCAGTGCAATCTGTCGCGCTGGTGCCTCCGGTTCAGCCGAGTCATGTTGGAACATCGATAATGGTGAATGGTTGTACAGGGAAAATGGGGCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764570.1
MAFVARASLNTSYTTWREHINLLNPCSELRIEKTFGNRLSSRTPIPRKSLVAVASNSVQSVALVPPVQPSHVGTSIMVNGCTGKMGRAVLEAAMAAGLNPVPVALGGPEDVGKILDFSGTQIEIHGPSDRESILSSTYKDYPDLIVVDYTVPAAVNDNAALYCKVGVPFVMGTTGGDRELLYKTVGDSKVYAVISPQMGKQVVAFLAAMEIMAEQFPGAFSGYDLQVMESHQASKLDVSGTAKAVISCFQKLGAEFEEEQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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