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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000860`

染色体: Chr05 坐标: 6836833-6839754 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000860`
名称	SmilChr05G000860
描述	E3 ubiquitin-protein ligase AIRP2-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	6836833 - 6839754 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985575`
GeneID	`130985575`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985575`
原始查询	`SmilChr05G000860`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	E3 ubiquitin-protein ligase AIRP2-like
产物	E3 ubiquitin-protein ligase AIRP2-like
Arabidopsis	`AT3G47160` (AT3G47160) RING/U-box superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823869] identity=68; qcov=0.964; evalue=2.05e-128; confidence=high
Rice	`Os07g0661600` (OsRFPHC-4) - identity=75.8; qcov=0.96; evalue=4.07e-144; confidence=high
GO	GO:0016567 (protein ubiquitination); GO:0061630 (ubiquitin protein ligase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00097 (zf-C3HC4); PF13639 (zf-RING_2); PF13920 (zf-C3HC4_3); PF14447 (Prok-RING_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985575

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057764602.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057764602.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057764602.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:6838369`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1
`Chr5:6838579`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr5:6838609`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr5:6838621`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B27,C8
`Chr5:6838633`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B27
`Chr5:6838668`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr5:6838725`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36
`Chr5:6839231`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr5:6839240`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764602.1

250 aa

125

250

zf-C3HC4_3

zf-RING_2

zf-C3HC4

Prok-RING_4

PF13920 zf-C3HC4_3 151-197 aa PF13639 zf-RING_2 153-192 aa PF00097 zf-C3HC4 154-191 aa PF14447 Prok-RING_4 154-196 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764602.1`	Pfam	`PF13920`	zf-C3HC4_3	Domain	151	197	8.4e-11	42.2	Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)
`XP_057764602.1`	Pfam	`PF13639`	zf-RING_2	Domain	153	192	2.1e-08	35.0	Ring finger domain
`XP_057764602.1`	Pfam	`PF00097`	zf-C3HC4	Domain	154	191	8.9e-06	26.2	Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)
`XP_057764602.1`	Pfam	`PF14447`	Prok-RING_4	Family	154	196	6.1e-07	30.0	Prokaryotic RING finger family 4

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908619.1
CGTGTCCCCTTTATCTCTTCTCTTTGATATATCCAAAGAAGAAAACTCTAAATTTGAGGGAGAGAGTGTCAGTTTCAGTCAGAGAAATTTCTTTTGAAATTCTTTACATACAAAAAAACGAAATAAAACATCTCCAGAAATATCTATCCATCCAATCCAAGTTCAGTTTTCGGAATTTAATTTTCAATTTCAATTTTCAACGGAGTTGAAAGTTTCCATTTTTCATCAGCACTGATGATTGTTTGATCCTCGAAAAATAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985575
ATGTATGTAAGCGGCGGAAGTCCAATACGGAAGTCTTTCAAAGACTCGCTTAAAGTTCTTGAAGCCGATATTCAGCATGCTAATACTCTTGCATCTGATTTTCCAAGGGAGTATGATGGCGCGTGTCTACAAATGAGAATGTCATACAGTCCAGCTGCTCACTTTTTCCTTTTTCTAGTTCAATGGACTGATTGCCACCTTGCCGGAGCTCTCGGACTGTTGCGGATCTTAATTTATAAGGTATATGTTGATGGCACCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764602.1
MYVSGGSPIRKSFKDSLKVLEADIQHANTLASDFPREYDGACLQMRMSYSPAAHFFLFLVQWTDCHLAGALGLLRILIYKVYVDGTTTMSTHERKASIREFYAVIYPSLMQLQQGVTDSEDRKQKAVCLERYRRKDEDDLSHCSESDVEREEECGICMETNSKIVLPNCNHAICLKCYREWRSRSQSCPFCRDSLKRVNSGDLWVLLDNKDVIDMAAITKENLKRLFMYIDKLPLIIPDNLFEPYDSHVR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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