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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000862`

染色体: Chr05 坐标: 6845442-6847668 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000862`
名称	SmilChr05G000862
描述	endonuclease 1
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	6845442 - 6847668 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985573`
GeneID	`130985573`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985573`
原始查询	`SmilChr05G000862`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	endonuclease 1
产物	endonuclease 1
Arabidopsis	`AT1G11190` (BFN1) bifunctional nuclease i [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837660] identity=72.5; qcov=0.873; evalue=2.15e-156; confidence=high
Rice	`Os04g0636400` - identity=69.7; qcov=0.89; evalue=9.15e-154; confidence=high
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004519 (endonuclease activity); GO:0006308 (DNA catabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF02265 (S1-P1_nuclease)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985573

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Lysosome	溶酶体	0.60000	`XP_057764599.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.40000	`XP_057764599.1`
3	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057764599.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:6845738`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B41,B79,C3,C59,D2
`Chr5:6846293`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B128,B2
`Chr5:6846574`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr5:6846962`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B33,C13,C70,C83,C84
`Chr5:6846985`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B87,B88
`Chr5:6847100`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B128,B2
`Chr5:6847138`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B131,B134,B47,C5,D7
`Chr5:6847614`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,C34
`Chr5:6847651`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764599.1

308 aa

154

308

S1-P1_nuclease

PF02265 S1-P1_nuclease 28-292 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764599.1`	Pfam	`PF02265`	S1-P1_nuclease	Domain	28	292	8.4e-86	288.7	S1/P1 Nuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908616.1
TCGAATTCCGAAATGTCGTTTTTAAGAGGAATTTCTGCATATTTCGTTGCTTTTCTTACTTGTGTTGTTGTTTACGAACCTTGTGTTCAAGCATGGAGCAAAGAGGGTCATGCCATGACTTGCAAAATTGCTCAGGACTTGCTCGAACCAGAGGCACACCACGCTGTTCAAATGCTACTGCCTGACTACGTGAAGGGCGATTTGTCGGCACTGTGCGTTTGGCCTGACCAAGTAAGACACTGGTATAGGTACCGCTGGAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985573
ATGTCGTTTTTAAGAGGAATTTCTGCATATTTCGTTGCTTTTCTTACTTGTGTTGTTGTTTACGAACCTTGTGTTCAAGCATGGAGCAAAGAGGGTCATGCCATGACTTGCAAAATTGCTCAGGACTTGCTCGAACCAGAGGCACACCACGCTGTTCAAATGCTACTGCCTGACTACGTGAAGGGCGATTTGTCGGCACTGTGCGTTTGGCCTGACCAAGTAAGACACTGGTATAGGTACCGCTGGACAAGCCCTCTTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764599.1
MSFLRGISAYFVAFLTCVVVYEPCVQAWSKEGHAMTCKIAQDLLEPEAHHAVQMLLPDYVKGDLSALCVWPDQVRHWYRYRWTSPLHFIDTPDGACNFKYQRDCHDPKGVKDMCVAGAIRNFTDQLSHYHHGTSDRRYNMTEALLFLAHFMGDIHQPMHVGFTSDEGGNTVELRWFRHKSNLHHVWDREIILTAAADYYGKDINLLQQDIQGNFTDGSWASDLASWRECVDISSCVNKYAGESMDMACRWGYKGVESGDT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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