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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000870`

染色体: Chr05 坐标: 6888764-6890560 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000870`
名称	SmilChr05G000870
描述	uncharacterized SmilChr05G000870
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	6888764 - 6890560 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985582`
GeneID	`130985582`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985582`
原始查询	`SmilChr05G000870`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	TatD related DNase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831623]; symbol=AT5G17570; hit=AT5G17570; species=arabidopsis; confidence=high
产物	TatD related DNase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831623]; symbol=AT5G17570; hit=AT5G17570; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G17570` (AT5G17570) TatD related DNase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831623] identity=62.7; qcov=1.06; evalue=3.81e-140; confidence=high
Rice	`Os04g0577500` - identity=62.4; qcov=1.02; evalue=6.83e-136; confidence=high
GO	GO:0016788 (hydrolase activity, acting on ester bonds)
KEGG	-
Pfam	PF01026 (TatD_DNase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985582

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057764610.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057764610.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057764610.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764610.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764610.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:6888871`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr5:6888932`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C73,D6
`Chr5:6888952`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B128
`Chr5:6889020`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:6889095`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B112,B79,C54
`Chr5:6889207`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:6889237`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B58
`Chr5:6889237`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B58
`Chr5:6889300`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36
`Chr5:6889436`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B112,B79,C54
`Chr5:6889437`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr5:6889480`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764610.1

288 aa

144

288

TatD_DNase

PF01026 TatD_DNase 5-279 aa

XP_057764611.1

288 aa

144

288

TatD_DNase

PF01026 TatD_DNase 5-279 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764610.1`	Pfam	`PF01026`	TatD_DNase	Domain	5	279	2.6e-64	217.8	TatD related DNase
`XP_057764611.1`	Pfam	`PF01026`	TatD_DNase	Domain	5	279	2.6e-64	217.8	TatD related DNase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908628.1
CATCAGATTCTATTTGAAGGGCGGGGCAATATTGGGATAAGCAGCAAAGATAAGGATATAACGGGAATATTGAAAGTCGTCGCGGCCGGCTCCCTTTCTTTATACTTTCTCCCGCTGGCACCGCTGCGGATTGCTCTCATCTCTCTCCAGCTGTTGCTTTTCGAGCTTTGTCCACAGGGGAAGATACGAGATTGACATCACTTGTTGATTGTGAGCGATGATCAGGCTTTTTGATTCTCATTGTCACTTACAAGATTCGA...

XM_057908627.1
CTTTCTTTATACTTTCTCCCGCTGGCACCGCTGCGGATTGCTCTCATCTCTCTCCAGGTTTCTCTCTCCTCCGTCTCTACCTCTCGAATTCTGATCTTATGCTATGTTGGTTGACCGTAGATATCAGTTTGAAATGCATTGATTCATAGAGTTAAAAAGGTTTTCTGATTACATACACAACTGATATCCAATTTTACTGGGCGAAATACGATTGTGCCTCTGTTGCTTTTCGAGCTTTGTCCACAGGGGAAGATACGAGA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130985582
ATGATCAGGCTTTTTGATTCTCATTGTCACTTACAAGATTCGAGAATCTTGAATGTGGCTCCTAAACTTATAAAAGAGGCCCTTGATACCGGTGTCCTTCACTTTGCCGTAAATGGAGTGTCTGAGAAGGACTGGCATTTGGTCAAGGAGATGAGTGAAACCCATCCTTCAGTTGTTCCGAACTTTGGCCTTCATCCCTGGTTTATATCCGATAGAACTCCCGATTGGCTGAAGACGTTGAAAGATTTCCTGGTATCCAC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057764610.1
MIRLFDSHCHLQDSRILNVAPKLIKEALDTGVLHFAVNGVSEKDWHLVKEMSETHPSVVPNFGLHPWFISDRTPDWLKTLKDFLVSTPSAAVGEIGLDKGSTGKKIDFTDQVEVFRQQLQLAKELNKPASIHCVRAFGDLLEILKSEGPFPAGLVLHSFLGSAEMVPELSKLGAYFSFSGFLMSMKESKAKKMLKSVPPERILLETDAPDARPSSVDPDSLFVIKTEVSSGDEDTSIVEENINHPANIHHILAYVAHFLE...

XP_057764611.1
MIRLFDSHCHLQDSRILNVAPKLIKEALDTGVLHFAVNGVSEKDWHLVKEMSETHPSVVPNFGLHPWFISDRTPDWLKTLKDFLVSTPSAAVGEIGLDKGSTGKKIDFTDQVEVFRQQLQLAKELNKPASIHCVRAFGDLLEILKSEGPFPAGLVLHSFLGSAEMVPELSKLGAYFSFSGFLMSMKESKAKKMLKSVPPERILLETDAPDARPSSVDPDSLFVIKTEVSSGDEDTSIVEENINHPANIHHILAYVAHFLE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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