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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000873`

染色体: Chr05 坐标: 6924998-6926946 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000873`
名称	SmilChr05G000873
描述	uncharacterized SmilChr05G000873
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	6924998 - 6926946 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985587`
GeneID	`130985587`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985587`
原始查询	`SmilChr05G000873`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cotton fiber (DUF761) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842420]; symbol=AT1G61260; hit=AT1G61260; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	cotton fiber (DUF761) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842420]; symbol=AT1G61260; hit=AT1G61260; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G61260` (AT1G61260) cotton fiber (DUF761) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842420] identity=41; qcov=1.09; evalue=2.99e-71; confidence=medium
Rice	`Os07g0563400` (OJ1720_F04.106) - identity=52.9; qcov=0.476; evalue=2.62e-42; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05553 (DUF761); PF14364 (DUF4408)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985587

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057764631.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057764631.1`
3	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057764631.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764631.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764631.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:6925267`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1
`Chr5:6925452`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45
`Chr5:6925465`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B125
`Chr5:6925509`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38
`Chr5:6925522`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B114,C7
`Chr5:6925627`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B131,B134,B47,C5,D7
`Chr5:6925752`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr5:6925772`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B39
`Chr5:6925807`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:6925831`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr5:6926332`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B36,B57,C34,C36
`Chr5:6926521`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B89,C76

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764631.1

330 aa

165

330

DUF4408

DUF761

PF14364 DUF4408 38-70 aa PF05553 DUF761 293-328 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764631.1`	Pfam	`PF14364`	DUF4408	Family	38	70	6.8e-16	58.5	Domain of unknown function (DUF4408)
`XP_057764631.1`	Pfam	`PF05553`	DUF761	Family	293	328	2.2e-16	59.8	Cotton fibre expressed protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908648.1
GAATATAGTTTGACCCACACCTGGGCCAATCCACGCACGGCAAACCACAAGTTGCAACTCCTCATCTTGAGAAATCACTACTGTTTTTGTCCCCTTATCCAACGGCCCAGATTTAACGCCTTTGCAACAAACCGCGTCCTCCTCACCTTCCGCTCCACATTATAACTTCCCAACCGCACCACCTTCTCCCCAGCACCACTCCAATTCCCTTCACTACTCGTCTCATCTACTCTCTCTCTCTCAAACACACACACTCGCTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985587
ATGGGGGCGATGAACAGTTGGATGTCGATGAGGATGATTCTGATATCAGCTGGAGTTTTGTCCGCGGCTATGGGGCTCAAGTTGTCGATTCCGATCGCCGTGGACGGGGTTCCAGCGTTGTGGTCGGTCATTTTGTCGTGGATGAAGCCTCCGTATTTGTATATAATCATTAATGGCATCATCATCACCATCGCCGCGTCGTCGCGCTTCCACCAGAGCCAGACGGAGCCTGCGGCGGTTCGATCTGAGCACTTGATTTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764631.1
MGAMNSWMSMRMILISAGVLSAAMGLKLSIPIAVDGVPALWSVILSWMKPPYLYIIINGIIITIAASSRFHQSQTEPAAVRSEHLISVITPPAESFEPLSAPENVNTTAVPEPAAEVVVSAVEDRVVDLKPVVVNGSKIDFATEVDDLRILRAEAEDAFDESTLPYNPPLRETYSPEVQLESLFPAREKPLASSRFVHRKPSRTPPEGARALRRVARPKKQETLESTWKMITEGRHVPLTRHLKKSDTFEQHASPAMDHV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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