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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000874`

染色体: Chr05 坐标: 6929936-6931274 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000874`
名称	SmilChr05G000874
描述	syntaxin-125-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	6929936 - 6931274 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985589`
GeneID	`130985589`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985589`
原始查询	`SmilChr05G000874`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	syntaxin-125-like
产物	syntaxin-125-like
Arabidopsis	`AT1G11250` (SYP125) syntaxin of plants 125 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837666] identity=40.1; qcov=0.699; evalue=8.68e-46; confidence=medium
Rice	`Os06g0590500` - identity=33.8; qcov=0.929; evalue=5.77e-45; confidence=low
GO	GO:0016020 (membrane); GO:0016192 (vesicle-mediated transport)
KEGG	smil04130 (SNARE interactions in vesicular transport - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00804 (Syntaxin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985589

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057764636.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057764636.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764636.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764636.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764636.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:6930058`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr5:6930197`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:6930462`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B35,B60,C8,C9
`Chr5:6930963`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764636.1

296 aa

148

296

Syntaxin

PF00804 Syntaxin 22-164 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764636.1`	Pfam	`PF00804`	Syntaxin	Domain	22	164	3.4e-19	69.9	Syntaxin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908653.1
ATAAACGGTTTCAACTAACCAATGAATTCACAAACATCAATTCAGTCGGGTCTCCAACGTGGAAGAAAGGTTGGTCGTGATGAAAGTTCCCCGTTACAGCAGTAAAAACTCCAAAACAATGTGTTTGTGTAGCAATTTCCCAATTATTCCTTCCTTGCTTCTCCTCTTGATCCTCATCGGAGATACGAGGGAGGATGATCCATCATCAAACCTCGTAATCTCCATTGAGTTTTCGGCCCCGAAATTCTTCCGGAGAAGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985589
ATGGAGGAGAAGGGTTCGTCAAAGATGTACGTGGAGGCGGAGAGCAGGCAGGGGTCGTCGCACTGCCTCGAGATGTTCTCTGTGGAAGTGGACAATGTGAAGCAGGATCTGATGACTCTGGAGAGGCTGTACGACAGCCTTCAGGAATCCAATGAAGATATCAAAAACGCAGAGGATTCAACGATGATGAGAGAAATCCGAGGCCGCCTCAACACCGACCTCGACCACCTATTCAAGCTGGCTAAGCAGATCAACAAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764636.1
MEEKGSSKMYVEAESRQGSSHCLEMFSVEVDNVKQDLMTLERLYDSLQESNEDIKNAEDSTMMREIRGRLNTDLDHLFKLAKQINKKYEGLIRANAAQRGSADDQVRASMISDVADALQFLMRRFQSLRTQMETDHRQIIEAKFYAITREKATAEAIDNLIASEAAGSPIHHAIQELGRDPVAEAVAEIQERRDAMREIRRNLMALHQVLLGIAAPAAAEGQGGVSRGAAADAVVEGGAVAVAGVLGGGKGGGTGGLNDY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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