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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000880`

染色体: Chr05 坐标: 6975914-6978491 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000880`
名称	SmilChr05G000880
描述	uncharacterized SmilChr05G000880
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	6975914 - 6978491 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985594`
GeneID	`130985594`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985594`
原始查询	`SmilChr05G000880`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Translation initiation factor eIF3 subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842921]; symbol=AT1G66070; hit=AT1G66070; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Translation initiation factor eIF3 subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842921]; symbol=AT1G66070; hit=AT1G66070; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G66070` (AT1G66070) Translation initiation factor eIF3 subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842921] identity=64.3; qcov=1.02; evalue=1.3e-81; confidence=high
Rice	`Os02g0122300` (BIP121) - identity=58.8; qcov=1.04; evalue=1.45e-65; confidence=high
GO	GO:0003743 (translation initiation factor activity); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0005852 (eukaryotic translation initiation factor 3 complex)
KEGG	-
Pfam	PF08597 (eIF3_subunit)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985594

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057764641.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057764641.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057764641.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057764641.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764641.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:6976447`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,B24
`Chr5:6976683`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr5:6977143`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764641.1

225 aa

112

225

eIF3_subunit

PF08597 eIF3_subunit 2-225 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764641.1`	Pfam	`PF08597`	eIF3_subunit	Family	2	225	2.5e-54	185.4	Translation initiation factor eIF3 subunit

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908658.1
ATTTACAAATTCAGGCACACAGCTTACCATTTACACTTACAAACCTCACCTAAAACCACACTTTGTTACATATTCGATCGGAACACAGAAAAAACAAATAAGAGGCATAAACCACCGCCCTTTGGGTTGCAAAAAATAAGAGACATACACAGTAACCCTAGTAATAACTGCACCAGCTTCTCTCCCTCTCTCTTGCGCTTTCTCGTCGCCGTGCCACCATAGATTAGATAGCTTTCTGTTGGAGTGTTTTCTCTCACCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985594
ATGGAGGATTGGGAAGATGAGCCTGTTCCAGATATCCTGAGCAAAAAGGAGATACTGAAGAGCAATTGGGAGGATGAGGATTTGGACGATGACGATGTCAAGGATTCTTGGGAAGATGAAGAGGAGCCTACGAAGGAACCTAAAGCTGAGCCACTGCCACCTCCCGAAAAGTCCATTCAAAAGACAGCAGCAAAAACAGAAGAAAAGAAGGTGAAAGCTGTTCAAGCCACGAAAGAGGTGCCTTTAGATCCTATAGAAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764641.1
MEDWEDEPVPDILSKKEILKSNWEDEDLDDDDVKDSWEDEEEPTKEPKAEPLPPPEKSIQKTAAKTEEKKVKAVQATKEVPLDPIEEKLRQQRLVEEADFKSTAELFAKKGDEKTLDNFIPNSESDFLEYAEMISHKLRPYEKSYHYIGLLKSVMRLSLTSLKGADAKEIASSITAIANEKIKAEKEANASKKKTVGKKKQLHVGKPDDDVVVDGYDGYDDYDFM

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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