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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000883`

染色体: Chr05 坐标: 6993602-6997779 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000883`
名称	SmilChr05G000883
描述	uncharacterized SmilChr05G000883
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	6993602 - 6997779 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985597`
GeneID	`130985597`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985597`
原始查询	`SmilChr05G000883`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828237]; symbol=AT4G21520; hit=AT4G21520; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828237]; symbol=AT4G21520; hit=AT4G21520; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G21520` (AT4G21520) Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828237] identity=72.8; qcov=0.879; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0738000` (OsWD40-88) - identity=67.3; qcov=0.881; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00400 (WD40)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985597

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057764645.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057764645.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764645.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764645.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057764645.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:6993819`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B20
`Chr5:6994200`	`CCG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C19
`Chr5:6994200`	`CCG`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C19
`Chr5:6994211`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B56,B96
`Chr5:6994363`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,D2
`Chr5:6995128`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr5:6996358`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr5:6996549`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B87,D10
`Chr5:6997602`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B7,C11,C69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764645.1

430 aa

215

430

WD40

PF00400 WD40 75-99 aa PF00400 WD40 267-305 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764645.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	75	99	2.6e-22	79.0	WD domain, G-beta repeat
`XP_057764645.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	267	305	2.6e-22	79.0	WD domain, G-beta repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908662.1
AATACATTTGTGTCGCGGCGGTGGCGAGCGTACAGTGGTTAATTTAATTTTGGACCTAAAATTTGCCTCCATCCATCATTGGGCCGTTGGCTGTACCATACTTAGGCAAAAAATCTCCAGTAGGCCCAATCTGTAAAATCTCCCAGTGCCTATTGACGGCGACGTGTTTCGGAGAGCAGCGGCATTTTGCGGCGGCGGAGGATTATTAATGGCTGACGAAGCGGCGGAGCAGACGCGTCTTAGTTCGGAGTCTGCCGAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985597
ATGGCTGACGAAGCGGCGGAGCAGACGCGTCTTAGTTCGGAGTCTGCCGAAGACGGCGTGCTTCCTAGTTCGCAGTTCGCCGAAGACAGCGTGCCTCCTAGTTCGGAGTTCGTCGAAGACGGCGTCAGCAACTGGCCGACGGTTCAGTATGACGTCGCTCCATACAAAACCTACCATTTCTTCCAGCAGTTCAGAACTAACGAATCGAACCCTAACAATTTTCTCAAAGGCGTCAAATGGTCGCCGGACGGTTCGTGCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764645.1
MADEAAEQTRLSSESAEDGVLPSSQFAEDSVPPSSEFVEDGVSNWPTVQYDVAPYKTYHFFQQFRTNESNPNNFLKGVKWSPDGSCFLTCNEDNTLRVFSLPYNDIGGPDAPTCTPDSDSYEPNVVVSEGESAYDYCWYPYMSASNPDLCVFATSTRDHPIHLWDANSGQLRCTYRAYDAMDEITAAFSIGFNPGGNKIFAGYNKAIRIFEVHRPGRDFEQHSTVLGNKEGQSGIISSIAFSPTSSGMLAAGSYNQTTAM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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