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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000888`

染色体: Chr05 坐标: 7036207-7039360 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000888`
名称	SmilChr05G000888
描述	external alternative NAD(P)H-ubiquinone oxidoreductase B2, mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	7036207 - 7039360 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985602`
GeneID	`130985602`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985602`
原始查询	`SmilChr05G000888`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	external alternative NAD(P)H-ubiquinone oxidoreductase B2, mitochondrial-like
产物	external alternative NAD(P)H-ubiquinone oxidoreductase B2%2C mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT2G34520` (RPS14) mitochondrial ribosomal protein S14 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818015] identity=67.7; qcov=0.356; evalue=4.56e-41; confidence=low
Rice	`Os08g0120000` (OJ1005_B05.29-2) - identity=74; qcov=0.356; evalue=2.46e-44; confidence=low
GO	GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0015935 (small ribosomal subunit)
KEGG	smil00020 (Citrate cycle (TCA cycle) - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00190 (Oxidative phosphorylation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01200 (Carbon metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00253 (Ribosomal_S14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985602

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057764649.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764649.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764649.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764649.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057764649.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:7038520`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A13,B22,B47,C39,C59
`Chr5:7038631`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,C87
`Chr5:7038647`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C30,C35,C4,C52
`Chr5:7038864`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr5:7038955`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B23,B89

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764649.1

270 aa

135

270

Ribosomal_S14

PF00253 Ribosomal_S14 216-269 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764649.1`	Pfam	`PF00253`	Ribosomal_S14	Family	216	269	6.3e-25	87.4	Ribosomal protein S14p/S29e

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908666.1
CACACCCTTACACTAGACACTAGTAATCATATGGCTAAATTGGGCCGTGGAGGAAACCCTGAACGGGTTTTACAATTGCCCTTATGCGCCGCTTCAAGCCCTCATCGATTCGTCGTTCCAGCTAAAAGAGACTGTCCCTCACCCTCTCTGAACTAGCTCCCTCTTAAATTCTCAGGTGATCCAAGTCTAAAAATGCAGAAAATGGCGATTTTCCAGAGGTTTTCTAGAACTTTCCGCGAGAATTCTGCGCTTGCTAAAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985602
ATGCAGAAAATGGCGATTTTCCAGAGGTTTTCTAGAACTTTCCGCGAGAATTCTGCGCTTGCTAAAGCAACAAACGTTTTCACCATAGGTGGCGGAGATCTTATGGCATCTCCTCAGGCTAAGTCAGGTAATGGAATGAACATTTTCAATGCAACAGCAGCTGATGGCAAGAATAAGATGAAGGTGATATCACCAAGTAACTATTTTCTGTTCAATCAAATACGACCAAGTGTTACATGTGGAACTGTGGGACCTCACAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764649.1
MQKMAIFQRFSRTFRENSALAKATNVFTIGGGDLMASPQAKSGNGMNIFNATAADGKNKMKVISPSNYFLFNQIRPSVTCGTVGPHSTVETVRNIVRNATTQQGSYLANCAKHPEGPLCFRGEGRRCFHNFRYNHFGLFAPLRAEQAVDQLSGSVARRFYRRDEKPPRTHPDRNRNKLDHRRRLLAAKYELRRNLYKALCRDPNLPSAMRVKYRCKLSNLPRNSSFTRVRNRCIFSGRPRGVYKKFRMSRIVFRTLANQG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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