当前解析结果
SmilChr05G000899| 统一新 Gene ID | SmilChr05G000899 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G000899 |
| 描述 | protein MOTHER of FT and TFL1-like |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 7118975 - 7119860 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130985613 |
|---|---|
| GeneID | 130985613 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130985613 |
| 原始查询 | SmilChr05G000899 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | protein MOTHER of FT and TFL1-like |
| 产物 | protein MOTHER of FT and TFL1-like |
| Arabidopsis | AT1G18100 (E12A11)PEBP (phosphatidylethanolamine-binding protein) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838390] identity=53.8; qcov=0.972; evalue=2.5e-66; confidence=high |
| Rice | Os06g0498800 (OsMFT1)- identity=54.6; qcov=0.989; evalue=8.48e-66; confidence=high |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF01161 (PBP) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130985613 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057764662.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.60000 | XP_057764662.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.20000 | XP_057764662.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057764662.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057764662.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:7119062 |
GT |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B72 |
Chr5:7119062 |
GT |
G |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B72 |
Chr5:7119664 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A16 |
Chr5:7119685 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A16 |
Chr5:7119808 |
AC |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | A3 |
Chr5:7119808 |
AC |
A |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | A3 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057764662.1PF01161
PBP 42-163 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057764662.1 |
Pfam | PF01161 |
PBP | Domain | 42 | 163 | 2.3e-18 | 67.7 | Phosphatidylethanolamine-binding protein |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。