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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000900`

染色体: Chr05 坐标: 7120079-7121424 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000900`
名称	SmilChr05G000900
描述	uncharacterized SmilChr05G000900
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	7120079 - 7121424 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025465`
GeneID	`131025465`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025465`
原始查询	`SmilChr05G000900`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Polynucleotidyl transferase, ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817994]; symbol=AT2G34320; hit=AT2G34320; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Polynucleotidyl transferase, ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817994]; symbol=AT2G34320; hit=AT2G34320; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G34320` (AT2G34320) Polynucleotidyl transferase, ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817994] identity=29.1; qcov=0.845; evalue=2.2e-08; confidence=low
Rice	`Os06g0683500` - identity=37.2; qcov=0.415; evalue=1.29e-07; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF13456 (RVT_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025465

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057811243.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057811243.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057811243.1`
4	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057811243.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811243.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:7120087`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr5:7120886`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr5:7120980`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,C30,C73
`Chr5:7121028`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B32,C22,C71
`Chr5:7121066`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B61,C39
`Chr5:7121070`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B132,B2,B5,B67,B8
`Chr5:7121108`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A10
`Chr5:7121182`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A8,A9,B132,C85
`Chr5:7121235`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,C26
`Chr5:7121243`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,B67
`Chr5:7121273`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B14,B4,B48,B65,C64
`Chr5:7121317`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B122,B39,B97

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811243.1

207 aa

104

207

RVT_3

PF13456 RVT_3 127-203 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811243.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	127	203	3.5e-12	47.0	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955260.1
ATGTCTTTCGTTGGTTTTTTGATTGAGCAAACTTTACCGTTGGACGTGGGCAGCATGATTCGCTTCTCTATCCACCAGAATAACAGCAAACAAGTTGGCAATTTGTGGAAAGTTGGGGTGGTCTCTCTCCTCTGGAGTCTCTGGTCTCACCGCAACAACGTCATACACAACAATTTAGCACCTTCGCGCCACCTCATTCTCAAGCAGGTCCGGGTTTTTCTTTGTGAAGCTGCCAACAATTTCGTCCTTGGCACTATGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025465
ATGTCTTTCGTTGGTTTTTTGATTGAGCAAACTTTACCGTTGGACGTGGGCAGCATGATTCGCTTCTCTATCCACCAGAATAACAGCAAACAAGTTGGCAATTTGTGGAAAGTTGGGGTGGTCTCTCTCCTCTGGAGTCTCTGGTCTCACCGCAACAACGTCATACACAACAATTTAGCACCTTCGCGCCACCTCATTCTCAAGCAGGTCCGGGTTTTTCTTTGTGAAGCTGCCAACAATTTCGTCCTTGGCACTATGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811243.1
MSFVGFLIEQTLPLDVGSMIRFSIHQNNSKQVGNLWKVGVVSLLWSLWSHRNNVIHNNLAPSRHLILKQVRVFLCEAANNFVLGTMANSVTDLLILKNLSIAGQPRKPLSFIYVAWHLPPPSWIKVNTDGSVREGRIHAGGVFRNAFNDVLGCYHFSGGHGVAFEAELLAIIIAIESAHRAKWERVWFESDSSYVVQLLQSLSETDY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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